Protein–RNA interactions for Protein: Q640N4

Zfp248, Zinc finger protein 248, mousemouse

Predictions only

Length 576 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp248Q640N4 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
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Zfp248Q640N4 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Zfp248Q640N4 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp248Q640N4 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp248Q640N4 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Zfp248Q640N4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Zfp248Q640N4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Zfp248Q640N4 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Zfp248Q640N4 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Zfp248Q640N4 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Zfp248Q640N4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Zfp248Q640N4 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Zfp248Q640N4 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Zfp248Q640N4 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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