Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Ccdc18Q640L5 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Ccdc18Q640L5 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Ccdc18Q640L5 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Ccdc18Q640L5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Ccdc18Q640L5 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Ccdc18Q640L5 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
Ccdc18Q640L5 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Ccdc18Q640L5 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Ccdc18Q640L5 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Ccdc18Q640L5 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Ccdc18Q640L5 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Ccdc18Q640L5 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Ccdc18Q640L5 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Ccdc18Q640L5 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Ccdc18Q640L5 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Ccdc18Q640L5 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Ccdc18Q640L5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Ccdc18Q640L5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Ccdc18Q640L5 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Ccdc18Q640L5 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Ccdc18Q640L5 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Ccdc18Q640L5 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Ccdc18Q640L5 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Ccdc18Q640L5 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Ccdc18Q640L5 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Ccdc18Q640L5 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
Ccdc18Q640L5 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Ccdc18Q640L5 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
Ccdc18Q640L5 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Ccdc18Q640L5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
Ccdc18Q640L5 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.84
Ccdc18Q640L5 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.84
Ccdc18Q640L5 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
Ccdc18Q640L5 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.84
Ccdc18Q640L5 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Ccdc18Q640L5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Ccdc18Q640L5 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Ccdc18Q640L5 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Ccdc18Q640L5 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Ccdc18Q640L5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Ccdc18Q640L5 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Ccdc18Q640L5 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Ccdc18Q640L5 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Ccdc18Q640L5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Ccdc18Q640L5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Ccdc18Q640L5 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Ccdc18Q640L5 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Ccdc18Q640L5 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Ccdc18Q640L5 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
Ccdc18Q640L5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Ccdc18Q640L5 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Ccdc18Q640L5 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Ccdc18Q640L5 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Ccdc18Q640L5 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Ccdc18Q640L5 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
Ccdc18Q640L5 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
Ccdc18Q640L5 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Ccdc18Q640L5 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Ccdc18Q640L5 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Ccdc18Q640L5 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Ccdc18Q640L5 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Ccdc18Q640L5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Ccdc18Q640L5 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Ccdc18Q640L5 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Ccdc18Q640L5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
Ccdc18Q640L5 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
Ccdc18Q640L5 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
Ccdc18Q640L5 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
Ccdc18Q640L5 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Ccdc18Q640L5 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.82
Ccdc18Q640L5 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Ccdc18Q640L5 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Ccdc18Q640L5 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
Ccdc18Q640L5 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Ccdc18Q640L5 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Ccdc18Q640L5 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Ccdc18Q640L5 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Ccdc18Q640L5 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Ccdc18Q640L5 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
Ccdc18Q640L5 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Ccdc18Q640L5 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
Ccdc18Q640L5 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Ccdc18Q640L5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Ccdc18Q640L5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Ccdc18Q640L5 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Ccdc18Q640L5 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Ccdc18Q640L5 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Ccdc18Q640L5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Ccdc18Q640L5 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Ccdc18Q640L5 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Ccdc18Q640L5 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Ccdc18Q640L5 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Ccdc18Q640L5 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Ccdc18Q640L5 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Ccdc18Q640L5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Ccdc18Q640L5 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Ccdc18Q640L5 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
Ccdc18Q640L5 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
Ccdc18Q640L5 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms