Protein–RNA interactions for Protein: Q62461

Gm20854, (clone BALB10N), mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20854Q62461 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20854Q62461 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20854Q62461 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20854Q62461 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20854Q62461 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20854Q62461 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20854Q62461 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20854Q62461 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20854Q62461 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20854Q62461 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20854Q62461 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20854Q62461 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20854Q62461 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20854Q62461 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20854Q62461 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20854Q62461 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20854Q62461 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20854Q62461 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20854Q62461 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20854Q62461 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20854Q62461 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20854Q62461 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20854Q62461 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20854Q62461 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20854Q62461 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20854Q62461 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20854Q62461 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20854Q62461 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm20854Q62461 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm20854Q62461 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm20854Q62461 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm20854Q62461 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm20854Q62461 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm20854Q62461 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm20854Q62461 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm20854Q62461 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm20854Q62461 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm20854Q62461 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm20854Q62461 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm20854Q62461 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm20854Q62461 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm20854Q62461 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm20854Q62461 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm20854Q62461 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm20854Q62461 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm20854Q62461 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm20854Q62461 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm20854Q62461 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm20854Q62461 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm20854Q62461 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm20854Q62461 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Gm20854Q62461 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm20854Q62461 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm20854Q62461 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20854Q62461 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20854Q62461 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20854Q62461 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20854Q62461 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20854Q62461 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20854Q62461 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20854Q62461 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20854Q62461 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20854Q62461 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Gm20854Q62461 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Gm20854Q62461 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20854Q62461 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20854Q62461 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20854Q62461 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20854Q62461 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20854Q62461 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20854Q62461 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20854Q62461 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20854Q62461 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20854Q62461 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm20854Q62461 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm20854Q62461 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm20854Q62461 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm20854Q62461 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm20854Q62461 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm20854Q62461 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20854Q62461 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20854Q62461 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20854Q62461 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20854Q62461 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20854Q62461 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20854Q62461 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20854Q62461 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20854Q62461 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20854Q62461 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20854Q62461 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20854Q62461 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20854Q62461 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20854Q62461 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20854Q62461 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20854Q62461 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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