Protein–RNA interactions for Protein: Q62442

Vamp1, Vesicle-associated membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp1Q62442 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vamp1Q62442 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vamp1Q62442 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vamp1Q62442 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vamp1Q62442 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vamp1Q62442 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vamp1Q62442 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vamp1Q62442 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vamp1Q62442 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vamp1Q62442 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vamp1Q62442 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vamp1Q62442 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vamp1Q62442 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Vamp1Q62442 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Vamp1Q62442 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vamp1Q62442 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vamp1Q62442 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vamp1Q62442 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vamp1Q62442 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vamp1Q62442 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vamp1Q62442 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vamp1Q62442 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vamp1Q62442 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vamp1Q62442 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vamp1Q62442 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vamp1Q62442 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vamp1Q62442 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vamp1Q62442 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vamp1Q62442 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Vamp1Q62442 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vamp1Q62442 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vamp1Q62442 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vamp1Q62442 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vamp1Q62442 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vamp1Q62442 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vamp1Q62442 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vamp1Q62442 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vamp1Q62442 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vamp1Q62442 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vamp1Q62442 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vamp1Q62442 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vamp1Q62442 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vamp1Q62442 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vamp1Q62442 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vamp1Q62442 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vamp1Q62442 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vamp1Q62442 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vamp1Q62442 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vamp1Q62442 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vamp1Q62442 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vamp1Q62442 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vamp1Q62442 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vamp1Q62442 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vamp1Q62442 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vamp1Q62442 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vamp1Q62442 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Vamp1Q62442 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vamp1Q62442 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vamp1Q62442 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vamp1Q62442 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vamp1Q62442 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vamp1Q62442 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vamp1Q62442 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vamp1Q62442 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vamp1Q62442 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vamp1Q62442 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vamp1Q62442 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vamp1Q62442 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vamp1Q62442 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vamp1Q62442 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vamp1Q62442 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vamp1Q62442 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vamp1Q62442 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vamp1Q62442 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vamp1Q62442 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vamp1Q62442 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vamp1Q62442 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vamp1Q62442 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vamp1Q62442 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vamp1Q62442 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Vamp1Q62442 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vamp1Q62442 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vamp1Q62442 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vamp1Q62442 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vamp1Q62442 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vamp1Q62442 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vamp1Q62442 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vamp1Q62442 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vamp1Q62442 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vamp1Q62442 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Vamp1Q62442 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Vamp1Q62442 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Vamp1Q62442 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vamp1Q62442 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vamp1Q62442 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vamp1Q62442 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vamp1Q62442 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vamp1Q62442 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vamp1Q62442 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vamp1Q62442 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms