Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ss18Q62280 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ss18Q62280 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ss18Q62280 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ss18Q62280 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ss18Q62280 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ss18Q62280 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ss18Q62280 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ss18Q62280 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ss18Q62280 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ss18Q62280 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ss18Q62280 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ss18Q62280 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ss18Q62280 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ss18Q62280 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ss18Q62280 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ss18Q62280 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ss18Q62280 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ss18Q62280 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ss18Q62280 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ss18Q62280 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ss18Q62280 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ss18Q62280 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ss18Q62280 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ss18Q62280 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ss18Q62280 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ss18Q62280 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ss18Q62280 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ss18Q62280 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ss18Q62280 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ss18Q62280 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ss18Q62280 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ss18Q62280 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ss18Q62280 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ss18Q62280 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ss18Q62280 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ss18Q62280 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ss18Q62280 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Ss18Q62280 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ss18Q62280 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ss18Q62280 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ss18Q62280 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ss18Q62280 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ss18Q62280 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ss18Q62280 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Ss18Q62280 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Ss18Q62280 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ss18Q62280 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ss18Q62280 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ss18Q62280 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ss18Q62280 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ss18Q62280 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ss18Q62280 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Ss18Q62280 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ss18Q62280 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Ss18Q62280 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Ss18Q62280 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ss18Q62280 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ss18Q62280 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ss18Q62280 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ss18Q62280 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Ss18Q62280 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Ss18Q62280 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ss18Q62280 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ss18Q62280 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ss18Q62280 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ss18Q62280 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ss18Q62280 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ss18Q62280 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ss18Q62280 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ss18Q62280 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ss18Q62280 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ss18Q62280 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ss18Q62280 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ss18Q62280 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ss18Q62280 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ss18Q62280 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ss18Q62280 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ss18Q62280 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ss18Q62280 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ss18Q62280 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
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