Protein–RNA interactions for Protein: Q62147

Sspn, Sarcospan, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SspnQ62147 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SspnQ62147 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SspnQ62147 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SspnQ62147 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SspnQ62147 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SspnQ62147 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SspnQ62147 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SspnQ62147 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SspnQ62147 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SspnQ62147 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SspnQ62147 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SspnQ62147 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SspnQ62147 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SspnQ62147 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SspnQ62147 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SspnQ62147 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SspnQ62147 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SspnQ62147 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SspnQ62147 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SspnQ62147 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SspnQ62147 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SspnQ62147 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SspnQ62147 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SspnQ62147 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SspnQ62147 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SspnQ62147 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SspnQ62147 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SspnQ62147 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SspnQ62147 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SspnQ62147 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SspnQ62147 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SspnQ62147 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SspnQ62147 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SspnQ62147 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SspnQ62147 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SspnQ62147 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SspnQ62147 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SspnQ62147 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SspnQ62147 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SspnQ62147 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SspnQ62147 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SspnQ62147 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SspnQ62147 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SspnQ62147 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SspnQ62147 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SspnQ62147 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SspnQ62147 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SspnQ62147 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SspnQ62147 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SspnQ62147 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SspnQ62147 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SspnQ62147 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SspnQ62147 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SspnQ62147 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SspnQ62147 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SspnQ62147 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SspnQ62147 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SspnQ62147 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SspnQ62147 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SspnQ62147 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SspnQ62147 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SspnQ62147 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SspnQ62147 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SspnQ62147 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SspnQ62147 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SspnQ62147 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SspnQ62147 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SspnQ62147 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SspnQ62147 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SspnQ62147 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SspnQ62147 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SspnQ62147 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SspnQ62147 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SspnQ62147 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SspnQ62147 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SspnQ62147 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SspnQ62147 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SspnQ62147 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SspnQ62147 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SspnQ62147 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SspnQ62147 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SspnQ62147 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SspnQ62147 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SspnQ62147 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SspnQ62147 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SspnQ62147 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SspnQ62147 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SspnQ62147 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SspnQ62147 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SspnQ62147 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SspnQ62147 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SspnQ62147 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SspnQ62147 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SspnQ62147 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SspnQ62147 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SspnQ62147 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SspnQ62147 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SspnQ62147 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SspnQ62147 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SspnQ62147 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms