Protein–RNA interactions for Protein: Q62100

Prm3, Protamine-3, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prm3Q62100 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prm3Q62100 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prm3Q62100 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prm3Q62100 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prm3Q62100 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prm3Q62100 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prm3Q62100 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prm3Q62100 Gm32296-201ENSMUST00000220590 1057 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prm3Q62100 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prm3Q62100 Rnase9-201ENSMUST00000064214 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prm3Q62100 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prm3Q62100 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prm3Q62100 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prm3Q62100 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prm3Q62100 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prm3Q62100 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
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Prm3Q62100 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prm3Q62100 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prm3Q62100 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
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Prm3Q62100 Gm38018-201ENSMUST00000195651 540 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Prm3Q62100 Gm43974-201ENSMUST00000205080 684 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Prm3Q62100 Gm34272-201ENSMUST00000208886 253 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Prm3Q62100 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prm3Q62100 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prm3Q62100 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prm3Q62100 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prm3Q62100 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prm3Q62100 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Prm3Q62100 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Prm3Q62100 Olfr967-202ENSMUST00000213358 1210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Prm3Q62100 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Prm3Q62100 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Prm3Q62100 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Prm3Q62100 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Prm3Q62100 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Prm3Q62100 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Prm3Q62100 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Prm3Q62100 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Prm3Q62100 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prm3Q62100 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prm3Q62100 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prm3Q62100 Gm19540-201ENSMUST00000221843 810 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Prm3Q62100 AC116589.3-201ENSMUST00000223034 1165 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prm3Q62100 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prm3Q62100 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prm3Q62100 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prm3Q62100 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prm3Q62100 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prm3Q62100 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prm3Q62100 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prm3Q62100 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prm3Q62100 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prm3Q62100 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prm3Q62100 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prm3Q62100 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prm3Q62100 4833421G17Rik-201ENSMUST00000191704 844 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Prm3Q62100 Gm39375-201ENSMUST00000217068 1039 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prm3Q62100 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Prm3Q62100 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
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Prm3Q62100 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prm3Q62100 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prm3Q62100 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
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Prm3Q62100 Prl7a1-203ENSMUST00000224852 1283 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Prm3Q62100 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prm3Q62100 5930422O12Rik-201ENSMUST00000059351 840 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prm3Q62100 Prl7a1-201ENSMUST00000006659 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prm3Q62100 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prm3Q62100 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prm3Q62100 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Prm3Q62100 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Prm3Q62100 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Prm3Q62100 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prm3Q62100 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prm3Q62100 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prm3Q62100 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prm3Q62100 Gm14659-201ENSMUST00000117667 843 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Prm3Q62100 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prm3Q62100 Gm28925-201ENSMUST00000188586 168 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Prm3Q62100 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prm3Q62100 CT009713.1-201ENSMUST00000224828 853 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Prm3Q62100 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prm3Q62100 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prm3Q62100 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prm3Q62100 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prm3Q62100 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prm3Q62100 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prm3Q62100 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prm3Q62100 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prm3Q62100 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prm3Q62100 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prm3Q62100 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms