Protein–RNA interactions for Protein: Q62066

Phox2a, Paired mesoderm homeobox protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2aQ62066 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Phox2aQ62066 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Phox2aQ62066 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Phox2aQ62066 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Phox2aQ62066 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Phox2aQ62066 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Phox2aQ62066 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Phox2aQ62066 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Phox2aQ62066 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Phox2aQ62066 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Phox2aQ62066 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Phox2aQ62066 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Phox2aQ62066 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Phox2aQ62066 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Phox2aQ62066 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Phox2aQ62066 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Phox2aQ62066 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Phox2aQ62066 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Phox2aQ62066 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Phox2aQ62066 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Phox2aQ62066 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Phox2aQ62066 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Phox2aQ62066 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Phox2aQ62066 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Phox2aQ62066 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Phox2aQ62066 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Phox2aQ62066 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Phox2aQ62066 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Phox2aQ62066 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Phox2aQ62066 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Phox2aQ62066 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Phox2aQ62066 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Phox2aQ62066 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Phox2aQ62066 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Phox2aQ62066 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Phox2aQ62066 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Phox2aQ62066 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Phox2aQ62066 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Phox2aQ62066 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Phox2aQ62066 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Phox2aQ62066 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Phox2aQ62066 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Phox2aQ62066 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Phox2aQ62066 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Phox2aQ62066 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Phox2aQ62066 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Phox2aQ62066 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Phox2aQ62066 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Phox2aQ62066 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Phox2aQ62066 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Phox2aQ62066 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Phox2aQ62066 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phox2aQ62066 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phox2aQ62066 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phox2aQ62066 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phox2aQ62066 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phox2aQ62066 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phox2aQ62066 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phox2aQ62066 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phox2aQ62066 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phox2aQ62066 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phox2aQ62066 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phox2aQ62066 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phox2aQ62066 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phox2aQ62066 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phox2aQ62066 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phox2aQ62066 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phox2aQ62066 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phox2aQ62066 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phox2aQ62066 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phox2aQ62066 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phox2aQ62066 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phox2aQ62066 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phox2aQ62066 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phox2aQ62066 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phox2aQ62066 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phox2aQ62066 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phox2aQ62066 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phox2aQ62066 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phox2aQ62066 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phox2aQ62066 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phox2aQ62066 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phox2aQ62066 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phox2aQ62066 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phox2aQ62066 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phox2aQ62066 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phox2aQ62066 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phox2aQ62066 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phox2aQ62066 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phox2aQ62066 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phox2aQ62066 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phox2aQ62066 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phox2aQ62066 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phox2aQ62066 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phox2aQ62066 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phox2aQ62066 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phox2aQ62066 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phox2aQ62066 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Phox2aQ62066 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phox2aQ62066 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms