Protein–RNA interactions for Protein: Q61897

Krt33b, Keratin, type I cuticular Ha3-II, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt33bQ61897 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt33bQ61897 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt33bQ61897 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt33bQ61897 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt33bQ61897 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt33bQ61897 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt33bQ61897 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt33bQ61897 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt33bQ61897 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt33bQ61897 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt33bQ61897 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt33bQ61897 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt33bQ61897 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt33bQ61897 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt33bQ61897 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt33bQ61897 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt33bQ61897 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt33bQ61897 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt33bQ61897 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt33bQ61897 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt33bQ61897 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt33bQ61897 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt33bQ61897 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt33bQ61897 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt33bQ61897 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt33bQ61897 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt33bQ61897 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt33bQ61897 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt33bQ61897 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt33bQ61897 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt33bQ61897 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt33bQ61897 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt33bQ61897 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt33bQ61897 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt33bQ61897 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt33bQ61897 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt33bQ61897 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt33bQ61897 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt33bQ61897 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt33bQ61897 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt33bQ61897 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt33bQ61897 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt33bQ61897 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt33bQ61897 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt33bQ61897 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt33bQ61897 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt33bQ61897 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt33bQ61897 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt33bQ61897 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt33bQ61897 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt33bQ61897 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt33bQ61897 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt33bQ61897 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt33bQ61897 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt33bQ61897 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt33bQ61897 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt33bQ61897 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt33bQ61897 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt33bQ61897 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt33bQ61897 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt33bQ61897 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt33bQ61897 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt33bQ61897 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt33bQ61897 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt33bQ61897 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt33bQ61897 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt33bQ61897 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt33bQ61897 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt33bQ61897 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt33bQ61897 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt33bQ61897 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt33bQ61897 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt33bQ61897 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt33bQ61897 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt33bQ61897 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt33bQ61897 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt33bQ61897 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt33bQ61897 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt33bQ61897 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt33bQ61897 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt33bQ61897 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt33bQ61897 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Krt33bQ61897 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Krt33bQ61897 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt33bQ61897 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt33bQ61897 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt33bQ61897 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt33bQ61897 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt33bQ61897 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt33bQ61897 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt33bQ61897 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt33bQ61897 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt33bQ61897 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt33bQ61897 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt33bQ61897 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt33bQ61897 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt33bQ61897 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt33bQ61897 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt33bQ61897 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt33bQ61897 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 187 ms