Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Itga6Q61739 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Itga6Q61739 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Itga6Q61739 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Itga6Q61739 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Itga6Q61739 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Itga6Q61739 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Itga6Q61739 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Itga6Q61739 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Itga6Q61739 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Itga6Q61739 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Itga6Q61739 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Itga6Q61739 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Itga6Q61739 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Itga6Q61739 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Itga6Q61739 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Itga6Q61739 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Itga6Q61739 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Itga6Q61739 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Itga6Q61739 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Itga6Q61739 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Itga6Q61739 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Itga6Q61739 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Itga6Q61739 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Itga6Q61739 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Itga6Q61739 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Itga6Q61739 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Itga6Q61739 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Itga6Q61739 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Itga6Q61739 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Itga6Q61739 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Itga6Q61739 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Itga6Q61739 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Itga6Q61739 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Itga6Q61739 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Itga6Q61739 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Itga6Q61739 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Itga6Q61739 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Itga6Q61739 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Itga6Q61739 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Itga6Q61739 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Itga6Q61739 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Itga6Q61739 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Itga6Q61739 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Itga6Q61739 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Itga6Q61739 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Itga6Q61739 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Itga6Q61739 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Itga6Q61739 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Itga6Q61739 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Itga6Q61739 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Itga6Q61739 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Itga6Q61739 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Itga6Q61739 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Itga6Q61739 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Itga6Q61739 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Itga6Q61739 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Itga6Q61739 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Itga6Q61739 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Itga6Q61739 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Itga6Q61739 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Itga6Q61739 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Itga6Q61739 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Itga6Q61739 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Itga6Q61739 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Itga6Q61739 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Itga6Q61739 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Itga6Q61739 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Itga6Q61739 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Itga6Q61739 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Itga6Q61739 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Itga6Q61739 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Itga6Q61739 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Itga6Q61739 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Itga6Q61739 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Itga6Q61739 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Itga6Q61739 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Itga6Q61739 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Itga6Q61739 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Itga6Q61739 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Itga6Q61739 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Itga6Q61739 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Itga6Q61739 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Itga6Q61739 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Itga6Q61739 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Itga6Q61739 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Itga6Q61739 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Itga6Q61739 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Itga6Q61739 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Itga6Q61739 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Itga6Q61739 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Itga6Q61739 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Itga6Q61739 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Itga6Q61739 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Itga6Q61739 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Itga6Q61739 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Itga6Q61739 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Itga6Q61739 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Itga6Q61739 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Itga6Q61739 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms