Protein–RNA interactions for Protein: Q61043

Nin, Ninein, mousemouse

Predictions only

Length 2,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NinQ61043 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NinQ61043 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NinQ61043 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NinQ61043 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NinQ61043 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NinQ61043 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NinQ61043 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NinQ61043 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NinQ61043 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NinQ61043 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NinQ61043 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NinQ61043 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NinQ61043 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NinQ61043 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NinQ61043 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NinQ61043 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NinQ61043 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NinQ61043 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NinQ61043 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NinQ61043 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NinQ61043 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NinQ61043 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NinQ61043 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NinQ61043 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NinQ61043 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NinQ61043 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NinQ61043 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NinQ61043 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NinQ61043 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NinQ61043 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NinQ61043 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NinQ61043 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NinQ61043 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NinQ61043 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NinQ61043 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NinQ61043 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NinQ61043 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NinQ61043 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NinQ61043 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NinQ61043 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NinQ61043 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NinQ61043 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NinQ61043 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NinQ61043 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NinQ61043 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NinQ61043 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NinQ61043 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NinQ61043 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NinQ61043 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NinQ61043 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NinQ61043 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NinQ61043 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NinQ61043 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NinQ61043 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NinQ61043 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NinQ61043 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NinQ61043 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NinQ61043 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NinQ61043 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NinQ61043 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NinQ61043 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NinQ61043 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NinQ61043 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NinQ61043 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NinQ61043 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NinQ61043 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NinQ61043 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NinQ61043 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NinQ61043 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NinQ61043 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NinQ61043 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NinQ61043 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NinQ61043 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NinQ61043 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NinQ61043 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NinQ61043 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NinQ61043 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NinQ61043 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NinQ61043 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NinQ61043 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NinQ61043 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NinQ61043 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NinQ61043 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NinQ61043 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NinQ61043 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NinQ61043 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NinQ61043 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NinQ61043 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NinQ61043 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NinQ61043 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NinQ61043 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NinQ61043 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NinQ61043 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NinQ61043 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NinQ61043 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NinQ61043 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NinQ61043 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NinQ61043 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NinQ61043 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NinQ61043 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms