Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Samhd1Q60710 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Samhd1Q60710 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Samhd1Q60710 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Samhd1Q60710 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Samhd1Q60710 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Samhd1Q60710 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Samhd1Q60710 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Samhd1Q60710 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Samhd1Q60710 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Samhd1Q60710 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Samhd1Q60710 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Samhd1Q60710 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Samhd1Q60710 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Samhd1Q60710 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Samhd1Q60710 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Samhd1Q60710 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Samhd1Q60710 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Samhd1Q60710 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Samhd1Q60710 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Samhd1Q60710 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Samhd1Q60710 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Samhd1Q60710 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Samhd1Q60710 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Samhd1Q60710 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Samhd1Q60710 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Samhd1Q60710 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Samhd1Q60710 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Samhd1Q60710 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Samhd1Q60710 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Samhd1Q60710 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Samhd1Q60710 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Samhd1Q60710 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Samhd1Q60710 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Samhd1Q60710 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Samhd1Q60710 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Samhd1Q60710 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Samhd1Q60710 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Samhd1Q60710 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Samhd1Q60710 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Samhd1Q60710 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Samhd1Q60710 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Samhd1Q60710 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Samhd1Q60710 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Samhd1Q60710 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Samhd1Q60710 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Samhd1Q60710 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Samhd1Q60710 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Samhd1Q60710 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Samhd1Q60710 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Samhd1Q60710 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Samhd1Q60710 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Samhd1Q60710 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Samhd1Q60710 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Samhd1Q60710 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Samhd1Q60710 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Samhd1Q60710 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Samhd1Q60710 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Samhd1Q60710 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Samhd1Q60710 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Samhd1Q60710 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Samhd1Q60710 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Samhd1Q60710 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Samhd1Q60710 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Samhd1Q60710 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Samhd1Q60710 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Samhd1Q60710 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Samhd1Q60710 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Samhd1Q60710 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Samhd1Q60710 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Samhd1Q60710 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Samhd1Q60710 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Samhd1Q60710 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Samhd1Q60710 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Samhd1Q60710 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Samhd1Q60710 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Samhd1Q60710 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Samhd1Q60710 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Samhd1Q60710 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Samhd1Q60710 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Samhd1Q60710 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Samhd1Q60710 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Samhd1Q60710 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Samhd1Q60710 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Samhd1Q60710 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Samhd1Q60710 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Samhd1Q60710 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Samhd1Q60710 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Samhd1Q60710 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Samhd1Q60710 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Samhd1Q60710 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Samhd1Q60710 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Samhd1Q60710 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Samhd1Q60710 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Samhd1Q60710 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Samhd1Q60710 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Samhd1Q60710 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Samhd1Q60710 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Samhd1Q60710 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Samhd1Q60710 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms