Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Foxd4Q60688 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Foxd4Q60688 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Foxd4Q60688 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Foxd4Q60688 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Foxd4Q60688 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Foxd4Q60688 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Foxd4Q60688 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Foxd4Q60688 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Foxd4Q60688 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Foxd4Q60688 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Foxd4Q60688 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Foxd4Q60688 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Foxd4Q60688 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Foxd4Q60688 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Foxd4Q60688 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Foxd4Q60688 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Foxd4Q60688 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Foxd4Q60688 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Foxd4Q60688 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Foxd4Q60688 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Foxd4Q60688 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Foxd4Q60688 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Foxd4Q60688 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Foxd4Q60688 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Foxd4Q60688 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Foxd4Q60688 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Foxd4Q60688 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Foxd4Q60688 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Foxd4Q60688 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Foxd4Q60688 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Foxd4Q60688 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Foxd4Q60688 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Foxd4Q60688 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Foxd4Q60688 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Foxd4Q60688 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Foxd4Q60688 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Foxd4Q60688 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Foxd4Q60688 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Foxd4Q60688 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Foxd4Q60688 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Foxd4Q60688 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Foxd4Q60688 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Foxd4Q60688 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Foxd4Q60688 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Foxd4Q60688 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Foxd4Q60688 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Foxd4Q60688 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Foxd4Q60688 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Foxd4Q60688 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Foxd4Q60688 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Foxd4Q60688 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Foxd4Q60688 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Foxd4Q60688 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Foxd4Q60688 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Foxd4Q60688 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Foxd4Q60688 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Foxd4Q60688 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Foxd4Q60688 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Foxd4Q60688 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Foxd4Q60688 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Foxd4Q60688 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Foxd4Q60688 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Foxd4Q60688 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Foxd4Q60688 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Foxd4Q60688 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Foxd4Q60688 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Foxd4Q60688 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Foxd4Q60688 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Foxd4Q60688 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Foxd4Q60688 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Foxd4Q60688 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Foxd4Q60688 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Foxd4Q60688 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Foxd4Q60688 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Foxd4Q60688 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Foxd4Q60688 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Foxd4Q60688 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Foxd4Q60688 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Foxd4Q60688 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Foxd4Q60688 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Foxd4Q60688 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Foxd4Q60688 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Foxd4Q60688 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Foxd4Q60688 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Foxd4Q60688 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Foxd4Q60688 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Foxd4Q60688 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Foxd4Q60688 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Foxd4Q60688 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Foxd4Q60688 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Foxd4Q60688 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Foxd4Q60688 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Foxd4Q60688 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Foxd4Q60688 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Foxd4Q60688 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Foxd4Q60688 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Foxd4Q60688 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Foxd4Q60688 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Foxd4Q60688 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms