Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CttnQ60598 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CttnQ60598 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CttnQ60598 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CttnQ60598 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CttnQ60598 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CttnQ60598 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CttnQ60598 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CttnQ60598 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CttnQ60598 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CttnQ60598 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CttnQ60598 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CttnQ60598 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CttnQ60598 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CttnQ60598 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CttnQ60598 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CttnQ60598 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CttnQ60598 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CttnQ60598 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CttnQ60598 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CttnQ60598 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CttnQ60598 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CttnQ60598 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CttnQ60598 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CttnQ60598 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CttnQ60598 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CttnQ60598 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CttnQ60598 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CttnQ60598 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CttnQ60598 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CttnQ60598 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CttnQ60598 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CttnQ60598 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CttnQ60598 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CttnQ60598 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CttnQ60598 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CttnQ60598 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CttnQ60598 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CttnQ60598 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CttnQ60598 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CttnQ60598 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CttnQ60598 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CttnQ60598 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CttnQ60598 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CttnQ60598 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CttnQ60598 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CttnQ60598 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CttnQ60598 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CttnQ60598 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CttnQ60598 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CttnQ60598 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CttnQ60598 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CttnQ60598 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CttnQ60598 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CttnQ60598 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CttnQ60598 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CttnQ60598 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CttnQ60598 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CttnQ60598 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CttnQ60598 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CttnQ60598 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CttnQ60598 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CttnQ60598 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CttnQ60598 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CttnQ60598 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CttnQ60598 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CttnQ60598 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CttnQ60598 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CttnQ60598 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CttnQ60598 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CttnQ60598 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CttnQ60598 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CttnQ60598 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CttnQ60598 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CttnQ60598 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CttnQ60598 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CttnQ60598 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CttnQ60598 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CttnQ60598 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CttnQ60598 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CttnQ60598 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CttnQ60598 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CttnQ60598 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CttnQ60598 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CttnQ60598 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CttnQ60598 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CttnQ60598 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CttnQ60598 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CttnQ60598 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CttnQ60598 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CttnQ60598 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CttnQ60598 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CttnQ60598 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CttnQ60598 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CttnQ60598 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CttnQ60598 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CttnQ60598 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CttnQ60598 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CttnQ60598 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CttnQ60598 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms