Protein–RNA interactions for Protein: Q5XFZ0

UPF0711 protein C18orf21 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5XFZ0 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q5XFZ0 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q5XFZ0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q5XFZ0 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Q5XFZ0 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q5XFZ0 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q5XFZ0 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q5XFZ0 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q5XFZ0 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q5XFZ0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Q5XFZ0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q5XFZ0 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q5XFZ0 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q5XFZ0 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q5XFZ0 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q5XFZ0 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q5XFZ0 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q5XFZ0 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q5XFZ0 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q5XFZ0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q5XFZ0 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q5XFZ0 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q5XFZ0 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Q5XFZ0 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q5XFZ0 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q5XFZ0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q5XFZ0 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q5XFZ0 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q5XFZ0 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q5XFZ0 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q5XFZ0 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q5XFZ0 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q5XFZ0 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q5XFZ0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q5XFZ0 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q5XFZ0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q5XFZ0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q5XFZ0 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q5XFZ0 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q5XFZ0 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q5XFZ0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Q5XFZ0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q5XFZ0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q5XFZ0 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q5XFZ0 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q5XFZ0 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q5XFZ0 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Q5XFZ0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q5XFZ0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q5XFZ0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q5XFZ0 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q5XFZ0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q5XFZ0 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q5XFZ0 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q5XFZ0 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Q5XFZ0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q5XFZ0 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q5XFZ0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q5XFZ0 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q5XFZ0 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q5XFZ0 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Q5XFZ0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q5XFZ0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q5XFZ0 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q5XFZ0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q5XFZ0 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Q5XFZ0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Q5XFZ0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q5XFZ0 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q5XFZ0 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q5XFZ0 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q5XFZ0 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q5XFZ0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q5XFZ0 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q5XFZ0 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q5XFZ0 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q5XFZ0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q5XFZ0 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q5XFZ0 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q5XFZ0 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q5XFZ0 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q5XFZ0 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q5XFZ0 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q5XFZ0 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q5XFZ0 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q5XFZ0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q5XFZ0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q5XFZ0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q5XFZ0 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q5XFZ0 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q5XFZ0 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q5XFZ0 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q5XFZ0 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q5XFZ0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q5XFZ0 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q5XFZ0 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q5XFZ0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q5XFZ0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q5XFZ0 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q5XFZ0 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms