Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSK3

Tefm, Transcription elongation factor, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefmQ5SSK3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TefmQ5SSK3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TefmQ5SSK3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TefmQ5SSK3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TefmQ5SSK3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TefmQ5SSK3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TefmQ5SSK3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TefmQ5SSK3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TefmQ5SSK3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TefmQ5SSK3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TefmQ5SSK3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TefmQ5SSK3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TefmQ5SSK3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TefmQ5SSK3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TefmQ5SSK3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TefmQ5SSK3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TefmQ5SSK3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TefmQ5SSK3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TefmQ5SSK3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TefmQ5SSK3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TefmQ5SSK3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TefmQ5SSK3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TefmQ5SSK3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TefmQ5SSK3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TefmQ5SSK3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TefmQ5SSK3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TefmQ5SSK3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TefmQ5SSK3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TefmQ5SSK3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TefmQ5SSK3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TefmQ5SSK3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TefmQ5SSK3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TefmQ5SSK3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TefmQ5SSK3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TefmQ5SSK3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TefmQ5SSK3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TefmQ5SSK3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TefmQ5SSK3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TefmQ5SSK3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TefmQ5SSK3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TefmQ5SSK3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TefmQ5SSK3 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TefmQ5SSK3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TefmQ5SSK3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TefmQ5SSK3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TefmQ5SSK3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TefmQ5SSK3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TefmQ5SSK3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TefmQ5SSK3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TefmQ5SSK3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TefmQ5SSK3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TefmQ5SSK3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TefmQ5SSK3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TefmQ5SSK3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TefmQ5SSK3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TefmQ5SSK3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TefmQ5SSK3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TefmQ5SSK3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TefmQ5SSK3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TefmQ5SSK3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TefmQ5SSK3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TefmQ5SSK3 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TefmQ5SSK3 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TefmQ5SSK3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TefmQ5SSK3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TefmQ5SSK3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TefmQ5SSK3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TefmQ5SSK3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TefmQ5SSK3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TefmQ5SSK3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TefmQ5SSK3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TefmQ5SSK3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TefmQ5SSK3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TefmQ5SSK3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TefmQ5SSK3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TefmQ5SSK3 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TefmQ5SSK3 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TefmQ5SSK3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TefmQ5SSK3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TefmQ5SSK3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TefmQ5SSK3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TefmQ5SSK3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TefmQ5SSK3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TefmQ5SSK3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18■□□□□ 0.47
TefmQ5SSK3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TefmQ5SSK3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TefmQ5SSK3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TefmQ5SSK3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TefmQ5SSK3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TefmQ5SSK3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TefmQ5SSK3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TefmQ5SSK3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TefmQ5SSK3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TefmQ5SSK3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TefmQ5SSK3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TefmQ5SSK3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TefmQ5SSK3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TefmQ5SSK3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TefmQ5SSK3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TefmQ5SSK3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms