Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU56

Nlrc3, Protein NLRC3, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc3Q5DU56 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nlrc3Q5DU56 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nlrc3Q5DU56 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nlrc3Q5DU56 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nlrc3Q5DU56 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nlrc3Q5DU56 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nlrc3Q5DU56 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nlrc3Q5DU56 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nlrc3Q5DU56 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nlrc3Q5DU56 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nlrc3Q5DU56 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nlrc3Q5DU56 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nlrc3Q5DU56 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nlrc3Q5DU56 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nlrc3Q5DU56 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Nlrc3Q5DU56 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nlrc3Q5DU56 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nlrc3Q5DU56 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nlrc3Q5DU56 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nlrc3Q5DU56 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nlrc3Q5DU56 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nlrc3Q5DU56 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Nlrc3Q5DU56 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nlrc3Q5DU56 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nlrc3Q5DU56 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nlrc3Q5DU56 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nlrc3Q5DU56 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nlrc3Q5DU56 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nlrc3Q5DU56 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nlrc3Q5DU56 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nlrc3Q5DU56 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nlrc3Q5DU56 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nlrc3Q5DU56 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nlrc3Q5DU56 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nlrc3Q5DU56 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nlrc3Q5DU56 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nlrc3Q5DU56 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nlrc3Q5DU56 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nlrc3Q5DU56 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nlrc3Q5DU56 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nlrc3Q5DU56 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nlrc3Q5DU56 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nlrc3Q5DU56 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nlrc3Q5DU56 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nlrc3Q5DU56 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nlrc3Q5DU56 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nlrc3Q5DU56 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nlrc3Q5DU56 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nlrc3Q5DU56 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nlrc3Q5DU56 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nlrc3Q5DU56 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nlrc3Q5DU56 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nlrc3Q5DU56 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nlrc3Q5DU56 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nlrc3Q5DU56 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nlrc3Q5DU56 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nlrc3Q5DU56 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nlrc3Q5DU56 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nlrc3Q5DU56 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Nlrc3Q5DU56 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nlrc3Q5DU56 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nlrc3Q5DU56 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nlrc3Q5DU56 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nlrc3Q5DU56 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nlrc3Q5DU56 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nlrc3Q5DU56 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nlrc3Q5DU56 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrc3Q5DU56 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrc3Q5DU56 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrc3Q5DU56 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrc3Q5DU56 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrc3Q5DU56 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrc3Q5DU56 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrc3Q5DU56 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrc3Q5DU56 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrc3Q5DU56 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrc3Q5DU56 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrc3Q5DU56 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrc3Q5DU56 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrc3Q5DU56 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrc3Q5DU56 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrc3Q5DU56 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nlrc3Q5DU56 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nlrc3Q5DU56 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nlrc3Q5DU56 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nlrc3Q5DU56 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Nlrc3Q5DU56 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nlrc3Q5DU56 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nlrc3Q5DU56 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nlrc3Q5DU56 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nlrc3Q5DU56 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nlrc3Q5DU56 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nlrc3Q5DU56 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nlrc3Q5DU56 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nlrc3Q5DU56 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Nlrc3Q5DU56 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nlrc3Q5DU56 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nlrc3Q5DU56 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nlrc3Q5DU56 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nlrc3Q5DU56 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms