Protein–RNA interactions for Protein: Q569L8

Cenpj, Centromere protein J, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpjQ569L8 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CenpjQ569L8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CenpjQ569L8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CenpjQ569L8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CenpjQ569L8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CenpjQ569L8 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CenpjQ569L8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CenpjQ569L8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CenpjQ569L8 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CenpjQ569L8 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CenpjQ569L8 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CenpjQ569L8 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CenpjQ569L8 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CenpjQ569L8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CenpjQ569L8 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CenpjQ569L8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CenpjQ569L8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CenpjQ569L8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CenpjQ569L8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CenpjQ569L8 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CenpjQ569L8 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CenpjQ569L8 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CenpjQ569L8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CenpjQ569L8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CenpjQ569L8 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CenpjQ569L8 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CenpjQ569L8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CenpjQ569L8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CenpjQ569L8 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CenpjQ569L8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CenpjQ569L8 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CenpjQ569L8 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CenpjQ569L8 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CenpjQ569L8 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CenpjQ569L8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CenpjQ569L8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CenpjQ569L8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CenpjQ569L8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CenpjQ569L8 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CenpjQ569L8 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CenpjQ569L8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CenpjQ569L8 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CenpjQ569L8 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CenpjQ569L8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CenpjQ569L8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CenpjQ569L8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CenpjQ569L8 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CenpjQ569L8 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CenpjQ569L8 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CenpjQ569L8 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CenpjQ569L8 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CenpjQ569L8 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CenpjQ569L8 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CenpjQ569L8 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CenpjQ569L8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CenpjQ569L8 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CenpjQ569L8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CenpjQ569L8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CenpjQ569L8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CenpjQ569L8 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CenpjQ569L8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CenpjQ569L8 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CenpjQ569L8 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CenpjQ569L8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CenpjQ569L8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CenpjQ569L8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CenpjQ569L8 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CenpjQ569L8 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CenpjQ569L8 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CenpjQ569L8 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CenpjQ569L8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CenpjQ569L8 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CenpjQ569L8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
CenpjQ569L8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CenpjQ569L8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CenpjQ569L8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CenpjQ569L8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CenpjQ569L8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CenpjQ569L8 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CenpjQ569L8 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CenpjQ569L8 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CenpjQ569L8 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CenpjQ569L8 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CenpjQ569L8 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CenpjQ569L8 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CenpjQ569L8 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CenpjQ569L8 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CenpjQ569L8 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CenpjQ569L8 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CenpjQ569L8 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CenpjQ569L8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CenpjQ569L8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CenpjQ569L8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CenpjQ569L8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CenpjQ569L8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CenpjQ569L8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CenpjQ569L8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CenpjQ569L8 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CenpjQ569L8 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CenpjQ569L8 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms