Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR2

Lrig2, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig2Q52KR2 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Lrig2Q52KR2 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Lrig2Q52KR2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrig2Q52KR2 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrig2Q52KR2 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrig2Q52KR2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrig2Q52KR2 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrig2Q52KR2 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrig2Q52KR2 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrig2Q52KR2 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrig2Q52KR2 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrig2Q52KR2 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrig2Q52KR2 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrig2Q52KR2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrig2Q52KR2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrig2Q52KR2 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrig2Q52KR2 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrig2Q52KR2 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrig2Q52KR2 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrig2Q52KR2 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrig2Q52KR2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrig2Q52KR2 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrig2Q52KR2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrig2Q52KR2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrig2Q52KR2 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrig2Q52KR2 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrig2Q52KR2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrig2Q52KR2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrig2Q52KR2 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrig2Q52KR2 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrig2Q52KR2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrig2Q52KR2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrig2Q52KR2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrig2Q52KR2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrig2Q52KR2 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrig2Q52KR2 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrig2Q52KR2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrig2Q52KR2 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrig2Q52KR2 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrig2Q52KR2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrig2Q52KR2 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrig2Q52KR2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrig2Q52KR2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrig2Q52KR2 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrig2Q52KR2 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrig2Q52KR2 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrig2Q52KR2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrig2Q52KR2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrig2Q52KR2 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrig2Q52KR2 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrig2Q52KR2 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrig2Q52KR2 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrig2Q52KR2 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrig2Q52KR2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrig2Q52KR2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrig2Q52KR2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrig2Q52KR2 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrig2Q52KR2 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrig2Q52KR2 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrig2Q52KR2 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrig2Q52KR2 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrig2Q52KR2 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrig2Q52KR2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrig2Q52KR2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrig2Q52KR2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrig2Q52KR2 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrig2Q52KR2 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrig2Q52KR2 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrig2Q52KR2 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrig2Q52KR2 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrig2Q52KR2 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrig2Q52KR2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrig2Q52KR2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrig2Q52KR2 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrig2Q52KR2 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrig2Q52KR2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrig2Q52KR2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrig2Q52KR2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrig2Q52KR2 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrig2Q52KR2 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrig2Q52KR2 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrig2Q52KR2 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrig2Q52KR2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrig2Q52KR2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrig2Q52KR2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrig2Q52KR2 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrig2Q52KR2 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrig2Q52KR2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrig2Q52KR2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrig2Q52KR2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrig2Q52KR2 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrig2Q52KR2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrig2Q52KR2 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrig2Q52KR2 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrig2Q52KR2 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrig2Q52KR2 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrig2Q52KR2 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrig2Q52KR2 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrig2Q52KR2 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Lrig2Q52KR2 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms