Protein–RNA interactions for Protein: Q52KE7

Ccnl1, Cyclin-L1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnl1Q52KE7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccnl1Q52KE7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccnl1Q52KE7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccnl1Q52KE7 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccnl1Q52KE7 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccnl1Q52KE7 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccnl1Q52KE7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccnl1Q52KE7 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccnl1Q52KE7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccnl1Q52KE7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccnl1Q52KE7 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccnl1Q52KE7 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccnl1Q52KE7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccnl1Q52KE7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccnl1Q52KE7 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccnl1Q52KE7 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccnl1Q52KE7 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccnl1Q52KE7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccnl1Q52KE7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccnl1Q52KE7 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccnl1Q52KE7 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccnl1Q52KE7 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccnl1Q52KE7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccnl1Q52KE7 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccnl1Q52KE7 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccnl1Q52KE7 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccnl1Q52KE7 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccnl1Q52KE7 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccnl1Q52KE7 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccnl1Q52KE7 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccnl1Q52KE7 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccnl1Q52KE7 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccnl1Q52KE7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccnl1Q52KE7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccnl1Q52KE7 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccnl1Q52KE7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccnl1Q52KE7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccnl1Q52KE7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccnl1Q52KE7 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccnl1Q52KE7 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccnl1Q52KE7 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccnl1Q52KE7 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccnl1Q52KE7 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccnl1Q52KE7 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccnl1Q52KE7 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccnl1Q52KE7 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccnl1Q52KE7 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccnl1Q52KE7 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccnl1Q52KE7 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccnl1Q52KE7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccnl1Q52KE7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccnl1Q52KE7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccnl1Q52KE7 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccnl1Q52KE7 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccnl1Q52KE7 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccnl1Q52KE7 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccnl1Q52KE7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccnl1Q52KE7 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccnl1Q52KE7 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccnl1Q52KE7 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccnl1Q52KE7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccnl1Q52KE7 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccnl1Q52KE7 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccnl1Q52KE7 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccnl1Q52KE7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccnl1Q52KE7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccnl1Q52KE7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccnl1Q52KE7 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccnl1Q52KE7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccnl1Q52KE7 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccnl1Q52KE7 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccnl1Q52KE7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccnl1Q52KE7 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccnl1Q52KE7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccnl1Q52KE7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccnl1Q52KE7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccnl1Q52KE7 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccnl1Q52KE7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccnl1Q52KE7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccnl1Q52KE7 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccnl1Q52KE7 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccnl1Q52KE7 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccnl1Q52KE7 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccnl1Q52KE7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccnl1Q52KE7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccnl1Q52KE7 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ccnl1Q52KE7 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccnl1Q52KE7 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccnl1Q52KE7 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccnl1Q52KE7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccnl1Q52KE7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccnl1Q52KE7 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccnl1Q52KE7 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccnl1Q52KE7 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccnl1Q52KE7 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccnl1Q52KE7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccnl1Q52KE7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccnl1Q52KE7 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccnl1Q52KE7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccnl1Q52KE7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms