Protein–RNA interactions for Protein: Q505D7

Opa3, Optic atrophy 3 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opa3Q505D7 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Opa3Q505D7 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Opa3Q505D7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Opa3Q505D7 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Opa3Q505D7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Opa3Q505D7 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Opa3Q505D7 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Opa3Q505D7 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Opa3Q505D7 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Opa3Q505D7 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Opa3Q505D7 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Opa3Q505D7 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Opa3Q505D7 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Opa3Q505D7 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Opa3Q505D7 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Opa3Q505D7 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Opa3Q505D7 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Opa3Q505D7 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Opa3Q505D7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Opa3Q505D7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Opa3Q505D7 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Opa3Q505D7 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Opa3Q505D7 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Opa3Q505D7 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Opa3Q505D7 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Opa3Q505D7 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Opa3Q505D7 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Opa3Q505D7 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Opa3Q505D7 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Opa3Q505D7 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Opa3Q505D7 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Opa3Q505D7 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Opa3Q505D7 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Opa3Q505D7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Opa3Q505D7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Opa3Q505D7 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Opa3Q505D7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Opa3Q505D7 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Opa3Q505D7 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Opa3Q505D7 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Opa3Q505D7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Opa3Q505D7 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Opa3Q505D7 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Opa3Q505D7 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Opa3Q505D7 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Opa3Q505D7 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Opa3Q505D7 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Opa3Q505D7 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Opa3Q505D7 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Opa3Q505D7 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Opa3Q505D7 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Opa3Q505D7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Opa3Q505D7 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Opa3Q505D7 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Opa3Q505D7 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Opa3Q505D7 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Opa3Q505D7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Opa3Q505D7 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Opa3Q505D7 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Opa3Q505D7 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Opa3Q505D7 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Opa3Q505D7 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Opa3Q505D7 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Opa3Q505D7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Opa3Q505D7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Opa3Q505D7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Opa3Q505D7 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Opa3Q505D7 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Opa3Q505D7 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Opa3Q505D7 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Opa3Q505D7 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Opa3Q505D7 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Opa3Q505D7 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Opa3Q505D7 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Opa3Q505D7 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Opa3Q505D7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Opa3Q505D7 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Opa3Q505D7 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Opa3Q505D7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Opa3Q505D7 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Opa3Q505D7 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Opa3Q505D7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Opa3Q505D7 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Opa3Q505D7 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Opa3Q505D7 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Opa3Q505D7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Opa3Q505D7 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Opa3Q505D7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Opa3Q505D7 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Opa3Q505D7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Opa3Q505D7 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Opa3Q505D7 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Opa3Q505D7 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Opa3Q505D7 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Opa3Q505D7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Opa3Q505D7 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Opa3Q505D7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Opa3Q505D7 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Opa3Q505D7 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Opa3Q505D7 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1182.8 ms