Protein–RNA interactions for Protein: Q497M3

Apobec4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec4Q497M3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Apobec4Q497M3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apobec4Q497M3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apobec4Q497M3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apobec4Q497M3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apobec4Q497M3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Apobec4Q497M3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apobec4Q497M3 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apobec4Q497M3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apobec4Q497M3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apobec4Q497M3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apobec4Q497M3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apobec4Q497M3 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apobec4Q497M3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apobec4Q497M3 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apobec4Q497M3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apobec4Q497M3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apobec4Q497M3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apobec4Q497M3 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apobec4Q497M3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Apobec4Q497M3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apobec4Q497M3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Apobec4Q497M3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apobec4Q497M3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apobec4Q497M3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apobec4Q497M3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apobec4Q497M3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apobec4Q497M3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apobec4Q497M3 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apobec4Q497M3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apobec4Q497M3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apobec4Q497M3 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Apobec4Q497M3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apobec4Q497M3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apobec4Q497M3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apobec4Q497M3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apobec4Q497M3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apobec4Q497M3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apobec4Q497M3 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apobec4Q497M3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apobec4Q497M3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apobec4Q497M3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apobec4Q497M3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apobec4Q497M3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apobec4Q497M3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apobec4Q497M3 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apobec4Q497M3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apobec4Q497M3 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apobec4Q497M3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apobec4Q497M3 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apobec4Q497M3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apobec4Q497M3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apobec4Q497M3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Apobec4Q497M3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apobec4Q497M3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apobec4Q497M3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Apobec4Q497M3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apobec4Q497M3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apobec4Q497M3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apobec4Q497M3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apobec4Q497M3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apobec4Q497M3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apobec4Q497M3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apobec4Q497M3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apobec4Q497M3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apobec4Q497M3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apobec4Q497M3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apobec4Q497M3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apobec4Q497M3 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apobec4Q497M3 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apobec4Q497M3 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apobec4Q497M3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apobec4Q497M3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apobec4Q497M3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apobec4Q497M3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apobec4Q497M3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apobec4Q497M3 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apobec4Q497M3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Apobec4Q497M3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apobec4Q497M3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apobec4Q497M3 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apobec4Q497M3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apobec4Q497M3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apobec4Q497M3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apobec4Q497M3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apobec4Q497M3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apobec4Q497M3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apobec4Q497M3 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apobec4Q497M3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apobec4Q497M3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Apobec4Q497M3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apobec4Q497M3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apobec4Q497M3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apobec4Q497M3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apobec4Q497M3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Apobec4Q497M3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Apobec4Q497M3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Apobec4Q497M3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Apobec4Q497M3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Apobec4Q497M3 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms