Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZRW6

Clul1, Clusterin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clul1Q3ZRW6 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Clul1Q3ZRW6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Clul1Q3ZRW6 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Clul1Q3ZRW6 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clul1Q3ZRW6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clul1Q3ZRW6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clul1Q3ZRW6 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clul1Q3ZRW6 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clul1Q3ZRW6 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clul1Q3ZRW6 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clul1Q3ZRW6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clul1Q3ZRW6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clul1Q3ZRW6 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clul1Q3ZRW6 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clul1Q3ZRW6 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clul1Q3ZRW6 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clul1Q3ZRW6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clul1Q3ZRW6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clul1Q3ZRW6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clul1Q3ZRW6 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clul1Q3ZRW6 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clul1Q3ZRW6 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clul1Q3ZRW6 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clul1Q3ZRW6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clul1Q3ZRW6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clul1Q3ZRW6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clul1Q3ZRW6 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clul1Q3ZRW6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clul1Q3ZRW6 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clul1Q3ZRW6 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clul1Q3ZRW6 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clul1Q3ZRW6 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clul1Q3ZRW6 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clul1Q3ZRW6 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clul1Q3ZRW6 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clul1Q3ZRW6 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Clul1Q3ZRW6 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clul1Q3ZRW6 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clul1Q3ZRW6 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clul1Q3ZRW6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clul1Q3ZRW6 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clul1Q3ZRW6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clul1Q3ZRW6 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clul1Q3ZRW6 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Clul1Q3ZRW6 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clul1Q3ZRW6 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Clul1Q3ZRW6 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clul1Q3ZRW6 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Clul1Q3ZRW6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clul1Q3ZRW6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clul1Q3ZRW6 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clul1Q3ZRW6 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Clul1Q3ZRW6 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clul1Q3ZRW6 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clul1Q3ZRW6 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Clul1Q3ZRW6 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clul1Q3ZRW6 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clul1Q3ZRW6 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clul1Q3ZRW6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clul1Q3ZRW6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clul1Q3ZRW6 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clul1Q3ZRW6 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clul1Q3ZRW6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clul1Q3ZRW6 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clul1Q3ZRW6 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clul1Q3ZRW6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clul1Q3ZRW6 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clul1Q3ZRW6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clul1Q3ZRW6 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clul1Q3ZRW6 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clul1Q3ZRW6 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Clul1Q3ZRW6 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clul1Q3ZRW6 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clul1Q3ZRW6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Clul1Q3ZRW6 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Clul1Q3ZRW6 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clul1Q3ZRW6 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clul1Q3ZRW6 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clul1Q3ZRW6 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Clul1Q3ZRW6 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clul1Q3ZRW6 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Clul1Q3ZRW6 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Clul1Q3ZRW6 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clul1Q3ZRW6 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clul1Q3ZRW6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clul1Q3ZRW6 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clul1Q3ZRW6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clul1Q3ZRW6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clul1Q3ZRW6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clul1Q3ZRW6 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clul1Q3ZRW6 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clul1Q3ZRW6 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clul1Q3ZRW6 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clul1Q3ZRW6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clul1Q3ZRW6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clul1Q3ZRW6 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clul1Q3ZRW6 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clul1Q3ZRW6 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Clul1Q3ZRW6 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clul1Q3ZRW6 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms