Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1L6

Mtmr11, Myotubularin-related protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr11Q3V1L6 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mtmr11Q3V1L6 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mtmr11Q3V1L6 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mtmr11Q3V1L6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mtmr11Q3V1L6 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mtmr11Q3V1L6 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mtmr11Q3V1L6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mtmr11Q3V1L6 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mtmr11Q3V1L6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mtmr11Q3V1L6 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mtmr11Q3V1L6 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mtmr11Q3V1L6 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mtmr11Q3V1L6 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mtmr11Q3V1L6 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mtmr11Q3V1L6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mtmr11Q3V1L6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mtmr11Q3V1L6 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mtmr11Q3V1L6 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mtmr11Q3V1L6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mtmr11Q3V1L6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mtmr11Q3V1L6 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Mtmr11Q3V1L6 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mtmr11Q3V1L6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mtmr11Q3V1L6 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mtmr11Q3V1L6 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mtmr11Q3V1L6 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mtmr11Q3V1L6 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mtmr11Q3V1L6 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mtmr11Q3V1L6 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mtmr11Q3V1L6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mtmr11Q3V1L6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mtmr11Q3V1L6 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mtmr11Q3V1L6 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Mtmr11Q3V1L6 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mtmr11Q3V1L6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mtmr11Q3V1L6 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mtmr11Q3V1L6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mtmr11Q3V1L6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mtmr11Q3V1L6 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mtmr11Q3V1L6 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mtmr11Q3V1L6 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mtmr11Q3V1L6 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mtmr11Q3V1L6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mtmr11Q3V1L6 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mtmr11Q3V1L6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mtmr11Q3V1L6 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mtmr11Q3V1L6 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mtmr11Q3V1L6 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mtmr11Q3V1L6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mtmr11Q3V1L6 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mtmr11Q3V1L6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mtmr11Q3V1L6 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mtmr11Q3V1L6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mtmr11Q3V1L6 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mtmr11Q3V1L6 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mtmr11Q3V1L6 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Mtmr11Q3V1L6 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mtmr11Q3V1L6 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mtmr11Q3V1L6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mtmr11Q3V1L6 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Mtmr11Q3V1L6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mtmr11Q3V1L6 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mtmr11Q3V1L6 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mtmr11Q3V1L6 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mtmr11Q3V1L6 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mtmr11Q3V1L6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mtmr11Q3V1L6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mtmr11Q3V1L6 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mtmr11Q3V1L6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mtmr11Q3V1L6 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mtmr11Q3V1L6 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Mtmr11Q3V1L6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mtmr11Q3V1L6 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mtmr11Q3V1L6 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mtmr11Q3V1L6 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mtmr11Q3V1L6 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mtmr11Q3V1L6 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mtmr11Q3V1L6 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mtmr11Q3V1L6 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mtmr11Q3V1L6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mtmr11Q3V1L6 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mtmr11Q3V1L6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mtmr11Q3V1L6 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mtmr11Q3V1L6 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mtmr11Q3V1L6 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mtmr11Q3V1L6 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mtmr11Q3V1L6 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mtmr11Q3V1L6 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mtmr11Q3V1L6 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mtmr11Q3V1L6 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mtmr11Q3V1L6 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mtmr11Q3V1L6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mtmr11Q3V1L6 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mtmr11Q3V1L6 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mtmr11Q3V1L6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mtmr11Q3V1L6 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mtmr11Q3V1L6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mtmr11Q3V1L6 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mtmr11Q3V1L6 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mtmr11Q3V1L6 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms