Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0K9

Pls1, Plastin-1, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pls1Q3V0K9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pls1Q3V0K9 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pls1Q3V0K9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pls1Q3V0K9 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pls1Q3V0K9 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pls1Q3V0K9 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pls1Q3V0K9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pls1Q3V0K9 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pls1Q3V0K9 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pls1Q3V0K9 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Pls1Q3V0K9 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pls1Q3V0K9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Pls1Q3V0K9 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pls1Q3V0K9 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pls1Q3V0K9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Pls1Q3V0K9 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pls1Q3V0K9 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Pls1Q3V0K9 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pls1Q3V0K9 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pls1Q3V0K9 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pls1Q3V0K9 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pls1Q3V0K9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pls1Q3V0K9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pls1Q3V0K9 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pls1Q3V0K9 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pls1Q3V0K9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pls1Q3V0K9 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pls1Q3V0K9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pls1Q3V0K9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pls1Q3V0K9 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pls1Q3V0K9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pls1Q3V0K9 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pls1Q3V0K9 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pls1Q3V0K9 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pls1Q3V0K9 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pls1Q3V0K9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pls1Q3V0K9 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pls1Q3V0K9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pls1Q3V0K9 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Pls1Q3V0K9 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pls1Q3V0K9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pls1Q3V0K9 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pls1Q3V0K9 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pls1Q3V0K9 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Pls1Q3V0K9 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pls1Q3V0K9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pls1Q3V0K9 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pls1Q3V0K9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pls1Q3V0K9 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pls1Q3V0K9 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Pls1Q3V0K9 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pls1Q3V0K9 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pls1Q3V0K9 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pls1Q3V0K9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pls1Q3V0K9 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pls1Q3V0K9 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pls1Q3V0K9 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pls1Q3V0K9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pls1Q3V0K9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pls1Q3V0K9 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pls1Q3V0K9 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pls1Q3V0K9 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pls1Q3V0K9 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pls1Q3V0K9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pls1Q3V0K9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pls1Q3V0K9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pls1Q3V0K9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pls1Q3V0K9 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pls1Q3V0K9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pls1Q3V0K9 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pls1Q3V0K9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pls1Q3V0K9 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Pls1Q3V0K9 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pls1Q3V0K9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pls1Q3V0K9 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pls1Q3V0K9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pls1Q3V0K9 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Pls1Q3V0K9 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pls1Q3V0K9 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pls1Q3V0K9 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pls1Q3V0K9 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pls1Q3V0K9 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pls1Q3V0K9 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pls1Q3V0K9 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pls1Q3V0K9 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pls1Q3V0K9 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pls1Q3V0K9 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pls1Q3V0K9 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pls1Q3V0K9 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pls1Q3V0K9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pls1Q3V0K9 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pls1Q3V0K9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pls1Q3V0K9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pls1Q3V0K9 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pls1Q3V0K9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pls1Q3V0K9 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pls1Q3V0K9 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Pls1Q3V0K9 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pls1Q3V0K9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pls1Q3V0K9 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms