Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0H9

4930596D02Rik, RIKEN cDNA 4930596D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930596D02RikQ3V0H9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
4930596D02RikQ3V0H9 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
4930596D02RikQ3V0H9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
4930596D02RikQ3V0H9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
4930596D02RikQ3V0H9 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
4930596D02RikQ3V0H9 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
4930596D02RikQ3V0H9 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
4930596D02RikQ3V0H9 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
4930596D02RikQ3V0H9 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
4930596D02RikQ3V0H9 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
4930596D02RikQ3V0H9 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
4930596D02RikQ3V0H9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
4930596D02RikQ3V0H9 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
4930596D02RikQ3V0H9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
4930596D02RikQ3V0H9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
4930596D02RikQ3V0H9 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
4930596D02RikQ3V0H9 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
4930596D02RikQ3V0H9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
4930596D02RikQ3V0H9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
4930596D02RikQ3V0H9 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
4930596D02RikQ3V0H9 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
4930596D02RikQ3V0H9 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
4930596D02RikQ3V0H9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
4930596D02RikQ3V0H9 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
4930596D02RikQ3V0H9 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
4930596D02RikQ3V0H9 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
4930596D02RikQ3V0H9 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
4930596D02RikQ3V0H9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
4930596D02RikQ3V0H9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
4930596D02RikQ3V0H9 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
4930596D02RikQ3V0H9 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
4930596D02RikQ3V0H9 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
4930596D02RikQ3V0H9 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
4930596D02RikQ3V0H9 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
4930596D02RikQ3V0H9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
4930596D02RikQ3V0H9 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
4930596D02RikQ3V0H9 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
4930596D02RikQ3V0H9 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
4930596D02RikQ3V0H9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
4930596D02RikQ3V0H9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
4930596D02RikQ3V0H9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
4930596D02RikQ3V0H9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
4930596D02RikQ3V0H9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
4930596D02RikQ3V0H9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
4930596D02RikQ3V0H9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
4930596D02RikQ3V0H9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
4930596D02RikQ3V0H9 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
4930596D02RikQ3V0H9 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
4930596D02RikQ3V0H9 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
4930596D02RikQ3V0H9 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
4930596D02RikQ3V0H9 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
4930596D02RikQ3V0H9 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
4930596D02RikQ3V0H9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
4930596D02RikQ3V0H9 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
4930596D02RikQ3V0H9 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
4930596D02RikQ3V0H9 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
4930596D02RikQ3V0H9 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
4930596D02RikQ3V0H9 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
4930596D02RikQ3V0H9 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
4930596D02RikQ3V0H9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
4930596D02RikQ3V0H9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
4930596D02RikQ3V0H9 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
4930596D02RikQ3V0H9 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
4930596D02RikQ3V0H9 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
4930596D02RikQ3V0H9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
4930596D02RikQ3V0H9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
4930596D02RikQ3V0H9 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
4930596D02RikQ3V0H9 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
4930596D02RikQ3V0H9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
4930596D02RikQ3V0H9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
4930596D02RikQ3V0H9 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
4930596D02RikQ3V0H9 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
4930596D02RikQ3V0H9 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
4930596D02RikQ3V0H9 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
4930596D02RikQ3V0H9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
4930596D02RikQ3V0H9 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
4930596D02RikQ3V0H9 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
4930596D02RikQ3V0H9 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
4930596D02RikQ3V0H9 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
4930596D02RikQ3V0H9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
4930596D02RikQ3V0H9 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
4930596D02RikQ3V0H9 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
4930596D02RikQ3V0H9 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
4930596D02RikQ3V0H9 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
4930596D02RikQ3V0H9 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
4930596D02RikQ3V0H9 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
4930596D02RikQ3V0H9 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
4930596D02RikQ3V0H9 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
4930596D02RikQ3V0H9 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
4930596D02RikQ3V0H9 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
4930596D02RikQ3V0H9 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
4930596D02RikQ3V0H9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
4930596D02RikQ3V0H9 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
4930596D02RikQ3V0H9 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
4930596D02RikQ3V0H9 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
4930596D02RikQ3V0H9 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
4930596D02RikQ3V0H9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
4930596D02RikQ3V0H9 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
4930596D02RikQ3V0H9 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
4930596D02RikQ3V0H9 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms