Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW13

D130052B06Rik, RIKEN cDNA D130052B06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130052B06RikQ3UW13 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
D130052B06RikQ3UW13 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
D130052B06RikQ3UW13 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
D130052B06RikQ3UW13 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
D130052B06RikQ3UW13 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
D130052B06RikQ3UW13 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
D130052B06RikQ3UW13 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
D130052B06RikQ3UW13 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
D130052B06RikQ3UW13 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
D130052B06RikQ3UW13 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
D130052B06RikQ3UW13 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
D130052B06RikQ3UW13 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
D130052B06RikQ3UW13 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
D130052B06RikQ3UW13 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
D130052B06RikQ3UW13 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
D130052B06RikQ3UW13 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
D130052B06RikQ3UW13 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
D130052B06RikQ3UW13 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
D130052B06RikQ3UW13 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
D130052B06RikQ3UW13 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
D130052B06RikQ3UW13 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
D130052B06RikQ3UW13 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
D130052B06RikQ3UW13 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
D130052B06RikQ3UW13 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
D130052B06RikQ3UW13 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
D130052B06RikQ3UW13 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
D130052B06RikQ3UW13 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
D130052B06RikQ3UW13 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
D130052B06RikQ3UW13 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
D130052B06RikQ3UW13 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
D130052B06RikQ3UW13 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
D130052B06RikQ3UW13 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
D130052B06RikQ3UW13 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
D130052B06RikQ3UW13 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
D130052B06RikQ3UW13 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
D130052B06RikQ3UW13 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
D130052B06RikQ3UW13 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
D130052B06RikQ3UW13 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
D130052B06RikQ3UW13 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
D130052B06RikQ3UW13 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
D130052B06RikQ3UW13 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
D130052B06RikQ3UW13 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
D130052B06RikQ3UW13 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
D130052B06RikQ3UW13 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
D130052B06RikQ3UW13 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
D130052B06RikQ3UW13 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
D130052B06RikQ3UW13 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
D130052B06RikQ3UW13 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
D130052B06RikQ3UW13 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
D130052B06RikQ3UW13 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
D130052B06RikQ3UW13 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
D130052B06RikQ3UW13 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
D130052B06RikQ3UW13 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
D130052B06RikQ3UW13 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
D130052B06RikQ3UW13 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
D130052B06RikQ3UW13 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
D130052B06RikQ3UW13 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
D130052B06RikQ3UW13 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
D130052B06RikQ3UW13 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
D130052B06RikQ3UW13 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
D130052B06RikQ3UW13 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
D130052B06RikQ3UW13 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
D130052B06RikQ3UW13 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
D130052B06RikQ3UW13 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
D130052B06RikQ3UW13 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
D130052B06RikQ3UW13 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
D130052B06RikQ3UW13 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
D130052B06RikQ3UW13 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
D130052B06RikQ3UW13 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
D130052B06RikQ3UW13 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
D130052B06RikQ3UW13 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
D130052B06RikQ3UW13 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
D130052B06RikQ3UW13 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
D130052B06RikQ3UW13 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
D130052B06RikQ3UW13 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
D130052B06RikQ3UW13 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
D130052B06RikQ3UW13 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
D130052B06RikQ3UW13 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
D130052B06RikQ3UW13 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
D130052B06RikQ3UW13 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
D130052B06RikQ3UW13 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
D130052B06RikQ3UW13 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
D130052B06RikQ3UW13 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
D130052B06RikQ3UW13 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
D130052B06RikQ3UW13 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
D130052B06RikQ3UW13 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
D130052B06RikQ3UW13 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
D130052B06RikQ3UW13 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
D130052B06RikQ3UW13 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
D130052B06RikQ3UW13 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
D130052B06RikQ3UW13 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
D130052B06RikQ3UW13 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
D130052B06RikQ3UW13 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
D130052B06RikQ3UW13 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
D130052B06RikQ3UW13 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
D130052B06RikQ3UW13 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
D130052B06RikQ3UW13 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
D130052B06RikQ3UW13 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
D130052B06RikQ3UW13 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
D130052B06RikQ3UW13 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms