Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUY6

Prom2, Prominin-2, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prom2Q3UUY6 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prom2Q3UUY6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prom2Q3UUY6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prom2Q3UUY6 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prom2Q3UUY6 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Prom2Q3UUY6 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Prom2Q3UUY6 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prom2Q3UUY6 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prom2Q3UUY6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prom2Q3UUY6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prom2Q3UUY6 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prom2Q3UUY6 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Prom2Q3UUY6 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prom2Q3UUY6 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prom2Q3UUY6 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Prom2Q3UUY6 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prom2Q3UUY6 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prom2Q3UUY6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prom2Q3UUY6 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prom2Q3UUY6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prom2Q3UUY6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prom2Q3UUY6 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prom2Q3UUY6 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prom2Q3UUY6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prom2Q3UUY6 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Prom2Q3UUY6 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prom2Q3UUY6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prom2Q3UUY6 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prom2Q3UUY6 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prom2Q3UUY6 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Prom2Q3UUY6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prom2Q3UUY6 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prom2Q3UUY6 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prom2Q3UUY6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prom2Q3UUY6 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prom2Q3UUY6 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prom2Q3UUY6 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prom2Q3UUY6 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Prom2Q3UUY6 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prom2Q3UUY6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prom2Q3UUY6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prom2Q3UUY6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Prom2Q3UUY6 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Prom2Q3UUY6 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prom2Q3UUY6 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prom2Q3UUY6 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prom2Q3UUY6 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prom2Q3UUY6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prom2Q3UUY6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prom2Q3UUY6 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prom2Q3UUY6 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prom2Q3UUY6 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prom2Q3UUY6 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prom2Q3UUY6 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prom2Q3UUY6 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prom2Q3UUY6 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prom2Q3UUY6 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prom2Q3UUY6 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prom2Q3UUY6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prom2Q3UUY6 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Prom2Q3UUY6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prom2Q3UUY6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prom2Q3UUY6 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prom2Q3UUY6 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prom2Q3UUY6 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Prom2Q3UUY6 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prom2Q3UUY6 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prom2Q3UUY6 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prom2Q3UUY6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prom2Q3UUY6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prom2Q3UUY6 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prom2Q3UUY6 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prom2Q3UUY6 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prom2Q3UUY6 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prom2Q3UUY6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prom2Q3UUY6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prom2Q3UUY6 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prom2Q3UUY6 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prom2Q3UUY6 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Prom2Q3UUY6 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prom2Q3UUY6 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prom2Q3UUY6 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prom2Q3UUY6 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prom2Q3UUY6 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Prom2Q3UUY6 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Prom2Q3UUY6 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Prom2Q3UUY6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Prom2Q3UUY6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Prom2Q3UUY6 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prom2Q3UUY6 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prom2Q3UUY6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prom2Q3UUY6 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prom2Q3UUY6 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prom2Q3UUY6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prom2Q3UUY6 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prom2Q3UUY6 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prom2Q3UUY6 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prom2Q3UUY6 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prom2Q3UUY6 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prom2Q3UUY6 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms