Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU41

Scimp, SLP adapter and CSK-interacting membrane protein, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScimpQ3UU41 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ScimpQ3UU41 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ScimpQ3UU41 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ScimpQ3UU41 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ScimpQ3UU41 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ScimpQ3UU41 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ScimpQ3UU41 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ScimpQ3UU41 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ScimpQ3UU41 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ScimpQ3UU41 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ScimpQ3UU41 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ScimpQ3UU41 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ScimpQ3UU41 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ScimpQ3UU41 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ScimpQ3UU41 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ScimpQ3UU41 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
ScimpQ3UU41 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ScimpQ3UU41 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ScimpQ3UU41 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ScimpQ3UU41 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ScimpQ3UU41 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ScimpQ3UU41 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ScimpQ3UU41 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ScimpQ3UU41 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ScimpQ3UU41 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ScimpQ3UU41 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ScimpQ3UU41 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ScimpQ3UU41 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ScimpQ3UU41 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ScimpQ3UU41 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ScimpQ3UU41 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ScimpQ3UU41 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ScimpQ3UU41 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ScimpQ3UU41 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ScimpQ3UU41 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ScimpQ3UU41 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ScimpQ3UU41 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ScimpQ3UU41 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ScimpQ3UU41 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ScimpQ3UU41 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ScimpQ3UU41 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ScimpQ3UU41 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ScimpQ3UU41 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ScimpQ3UU41 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ScimpQ3UU41 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ScimpQ3UU41 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ScimpQ3UU41 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ScimpQ3UU41 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ScimpQ3UU41 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ScimpQ3UU41 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ScimpQ3UU41 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ScimpQ3UU41 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ScimpQ3UU41 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ScimpQ3UU41 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ScimpQ3UU41 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ScimpQ3UU41 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ScimpQ3UU41 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ScimpQ3UU41 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ScimpQ3UU41 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ScimpQ3UU41 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ScimpQ3UU41 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ScimpQ3UU41 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ScimpQ3UU41 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ScimpQ3UU41 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ScimpQ3UU41 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ScimpQ3UU41 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ScimpQ3UU41 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ScimpQ3UU41 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ScimpQ3UU41 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ScimpQ3UU41 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ScimpQ3UU41 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ScimpQ3UU41 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ScimpQ3UU41 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ScimpQ3UU41 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ScimpQ3UU41 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ScimpQ3UU41 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ScimpQ3UU41 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ScimpQ3UU41 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ScimpQ3UU41 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ScimpQ3UU41 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ScimpQ3UU41 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ScimpQ3UU41 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ScimpQ3UU41 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ScimpQ3UU41 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ScimpQ3UU41 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ScimpQ3UU41 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ScimpQ3UU41 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ScimpQ3UU41 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ScimpQ3UU41 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ScimpQ3UU41 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ScimpQ3UU41 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ScimpQ3UU41 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ScimpQ3UU41 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ScimpQ3UU41 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ScimpQ3UU41 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ScimpQ3UU41 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ScimpQ3UU41 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ScimpQ3UU41 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ScimpQ3UU41 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ScimpQ3UU41 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms