Protein–RNA interactions for Protein: Q3USF0

B3gnt6, Acetylgalactosaminyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B3gnt6Q3USF0 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
B3gnt6Q3USF0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
B3gnt6Q3USF0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
B3gnt6Q3USF0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
B3gnt6Q3USF0 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
B3gnt6Q3USF0 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
B3gnt6Q3USF0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
B3gnt6Q3USF0 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
B3gnt6Q3USF0 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
B3gnt6Q3USF0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
B3gnt6Q3USF0 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
B3gnt6Q3USF0 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
B3gnt6Q3USF0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
B3gnt6Q3USF0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
B3gnt6Q3USF0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
B3gnt6Q3USF0 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
B3gnt6Q3USF0 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
B3gnt6Q3USF0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
B3gnt6Q3USF0 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
B3gnt6Q3USF0 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
B3gnt6Q3USF0 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
B3gnt6Q3USF0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
B3gnt6Q3USF0 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
B3gnt6Q3USF0 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
B3gnt6Q3USF0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
B3gnt6Q3USF0 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
B3gnt6Q3USF0 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
B3gnt6Q3USF0 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
B3gnt6Q3USF0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
B3gnt6Q3USF0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
B3gnt6Q3USF0 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
B3gnt6Q3USF0 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
B3gnt6Q3USF0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
B3gnt6Q3USF0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
B3gnt6Q3USF0 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
B3gnt6Q3USF0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
B3gnt6Q3USF0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
B3gnt6Q3USF0 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
B3gnt6Q3USF0 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
B3gnt6Q3USF0 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
B3gnt6Q3USF0 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
B3gnt6Q3USF0 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
B3gnt6Q3USF0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
B3gnt6Q3USF0 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
B3gnt6Q3USF0 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
B3gnt6Q3USF0 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
B3gnt6Q3USF0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
B3gnt6Q3USF0 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
B3gnt6Q3USF0 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
B3gnt6Q3USF0 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
B3gnt6Q3USF0 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
B3gnt6Q3USF0 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
B3gnt6Q3USF0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
B3gnt6Q3USF0 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
B3gnt6Q3USF0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
B3gnt6Q3USF0 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
B3gnt6Q3USF0 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
B3gnt6Q3USF0 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
B3gnt6Q3USF0 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
B3gnt6Q3USF0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
B3gnt6Q3USF0 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
B3gnt6Q3USF0 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
B3gnt6Q3USF0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
B3gnt6Q3USF0 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
B3gnt6Q3USF0 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
B3gnt6Q3USF0 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
B3gnt6Q3USF0 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
B3gnt6Q3USF0 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
B3gnt6Q3USF0 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
B3gnt6Q3USF0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
B3gnt6Q3USF0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
B3gnt6Q3USF0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
B3gnt6Q3USF0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
B3gnt6Q3USF0 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
B3gnt6Q3USF0 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
B3gnt6Q3USF0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
B3gnt6Q3USF0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
B3gnt6Q3USF0 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
B3gnt6Q3USF0 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
B3gnt6Q3USF0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
B3gnt6Q3USF0 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
B3gnt6Q3USF0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
B3gnt6Q3USF0 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
B3gnt6Q3USF0 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
B3gnt6Q3USF0 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
B3gnt6Q3USF0 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
B3gnt6Q3USF0 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
B3gnt6Q3USF0 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
B3gnt6Q3USF0 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
B3gnt6Q3USF0 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
B3gnt6Q3USF0 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
B3gnt6Q3USF0 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
B3gnt6Q3USF0 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
B3gnt6Q3USF0 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
B3gnt6Q3USF0 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
B3gnt6Q3USF0 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
B3gnt6Q3USF0 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
B3gnt6Q3USF0 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
B3gnt6Q3USF0 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
B3gnt6Q3USF0 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms