Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Znf48Q3US17 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Znf48Q3US17 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Znf48Q3US17 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Znf48Q3US17 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Znf48Q3US17 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Znf48Q3US17 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Znf48Q3US17 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Znf48Q3US17 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Znf48Q3US17 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Znf48Q3US17 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Znf48Q3US17 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Znf48Q3US17 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Znf48Q3US17 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Znf48Q3US17 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Znf48Q3US17 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Znf48Q3US17 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Znf48Q3US17 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Znf48Q3US17 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Znf48Q3US17 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Znf48Q3US17 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Znf48Q3US17 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Znf48Q3US17 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Znf48Q3US17 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Znf48Q3US17 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Znf48Q3US17 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Znf48Q3US17 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Znf48Q3US17 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Znf48Q3US17 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Znf48Q3US17 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Znf48Q3US17 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Znf48Q3US17 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Znf48Q3US17 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Znf48Q3US17 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Znf48Q3US17 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Znf48Q3US17 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Znf48Q3US17 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Znf48Q3US17 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Znf48Q3US17 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Znf48Q3US17 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Znf48Q3US17 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Znf48Q3US17 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Znf48Q3US17 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Znf48Q3US17 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Znf48Q3US17 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Znf48Q3US17 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Znf48Q3US17 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Znf48Q3US17 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Znf48Q3US17 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Znf48Q3US17 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Znf48Q3US17 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Znf48Q3US17 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Znf48Q3US17 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Znf48Q3US17 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Znf48Q3US17 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Znf48Q3US17 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Znf48Q3US17 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Znf48Q3US17 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Znf48Q3US17 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Znf48Q3US17 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf48Q3US17 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf48Q3US17 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf48Q3US17 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf48Q3US17 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf48Q3US17 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf48Q3US17 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf48Q3US17 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf48Q3US17 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf48Q3US17 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf48Q3US17 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf48Q3US17 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf48Q3US17 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf48Q3US17 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf48Q3US17 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf48Q3US17 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf48Q3US17 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf48Q3US17 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf48Q3US17 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf48Q3US17 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf48Q3US17 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf48Q3US17 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf48Q3US17 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf48Q3US17 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf48Q3US17 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf48Q3US17 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf48Q3US17 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf48Q3US17 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf48Q3US17 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf48Q3US17 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf48Q3US17 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf48Q3US17 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf48Q3US17 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf48Q3US17 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf48Q3US17 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf48Q3US17 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf48Q3US17 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf48Q3US17 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf48Q3US17 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf48Q3US17 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf48Q3US17 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms