Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmem253Q3UNB8 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmem253Q3UNB8 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmem253Q3UNB8 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmem253Q3UNB8 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmem253Q3UNB8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmem253Q3UNB8 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmem253Q3UNB8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmem253Q3UNB8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmem253Q3UNB8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmem253Q3UNB8 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmem253Q3UNB8 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmem253Q3UNB8 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmem253Q3UNB8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmem253Q3UNB8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmem253Q3UNB8 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmem253Q3UNB8 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmem253Q3UNB8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmem253Q3UNB8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmem253Q3UNB8 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmem253Q3UNB8 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmem253Q3UNB8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmem253Q3UNB8 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmem253Q3UNB8 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmem253Q3UNB8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmem253Q3UNB8 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmem253Q3UNB8 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmem253Q3UNB8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmem253Q3UNB8 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmem253Q3UNB8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmem253Q3UNB8 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmem253Q3UNB8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmem253Q3UNB8 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmem253Q3UNB8 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmem253Q3UNB8 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmem253Q3UNB8 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmem253Q3UNB8 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmem253Q3UNB8 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmem253Q3UNB8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmem253Q3UNB8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmem253Q3UNB8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmem253Q3UNB8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmem253Q3UNB8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
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Tmem253Q3UNB8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmem253Q3UNB8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmem253Q3UNB8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmem253Q3UNB8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmem253Q3UNB8 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmem253Q3UNB8 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmem253Q3UNB8 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmem253Q3UNB8 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmem253Q3UNB8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmem253Q3UNB8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmem253Q3UNB8 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmem253Q3UNB8 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmem253Q3UNB8 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmem253Q3UNB8 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmem253Q3UNB8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmem253Q3UNB8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmem253Q3UNB8 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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Tmem253Q3UNB8 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmem253Q3UNB8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmem253Q3UNB8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmem253Q3UNB8 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmem253Q3UNB8 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmem253Q3UNB8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmem253Q3UNB8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmem253Q3UNB8 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmem253Q3UNB8 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmem253Q3UNB8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmem253Q3UNB8 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem253Q3UNB8 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem253Q3UNB8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem253Q3UNB8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem253Q3UNB8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem253Q3UNB8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem253Q3UNB8 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem253Q3UNB8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem253Q3UNB8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem253Q3UNB8 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem253Q3UNB8 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem253Q3UNB8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem253Q3UNB8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem253Q3UNB8 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem253Q3UNB8 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem253Q3UNB8 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem253Q3UNB8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem253Q3UNB8 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem253Q3UNB8 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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