Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULD5

Mccc2, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mccc2Q3ULD5 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mccc2Q3ULD5 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mccc2Q3ULD5 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mccc2Q3ULD5 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Mccc2Q3ULD5 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mccc2Q3ULD5 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mccc2Q3ULD5 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mccc2Q3ULD5 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mccc2Q3ULD5 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mccc2Q3ULD5 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mccc2Q3ULD5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Mccc2Q3ULD5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mccc2Q3ULD5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mccc2Q3ULD5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mccc2Q3ULD5 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mccc2Q3ULD5 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mccc2Q3ULD5 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mccc2Q3ULD5 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mccc2Q3ULD5 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mccc2Q3ULD5 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mccc2Q3ULD5 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mccc2Q3ULD5 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mccc2Q3ULD5 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mccc2Q3ULD5 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mccc2Q3ULD5 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mccc2Q3ULD5 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mccc2Q3ULD5 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mccc2Q3ULD5 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mccc2Q3ULD5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mccc2Q3ULD5 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mccc2Q3ULD5 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mccc2Q3ULD5 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mccc2Q3ULD5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mccc2Q3ULD5 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mccc2Q3ULD5 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mccc2Q3ULD5 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Mccc2Q3ULD5 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mccc2Q3ULD5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mccc2Q3ULD5 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mccc2Q3ULD5 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mccc2Q3ULD5 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mccc2Q3ULD5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mccc2Q3ULD5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mccc2Q3ULD5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mccc2Q3ULD5 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mccc2Q3ULD5 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mccc2Q3ULD5 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mccc2Q3ULD5 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Mccc2Q3ULD5 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mccc2Q3ULD5 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mccc2Q3ULD5 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mccc2Q3ULD5 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mccc2Q3ULD5 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mccc2Q3ULD5 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Mccc2Q3ULD5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mccc2Q3ULD5 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mccc2Q3ULD5 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mccc2Q3ULD5 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mccc2Q3ULD5 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mccc2Q3ULD5 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mccc2Q3ULD5 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mccc2Q3ULD5 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mccc2Q3ULD5 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mccc2Q3ULD5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Mccc2Q3ULD5 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mccc2Q3ULD5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Mccc2Q3ULD5 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mccc2Q3ULD5 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mccc2Q3ULD5 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mccc2Q3ULD5 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Mccc2Q3ULD5 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mccc2Q3ULD5 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mccc2Q3ULD5 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mccc2Q3ULD5 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mccc2Q3ULD5 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mccc2Q3ULD5 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mccc2Q3ULD5 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mccc2Q3ULD5 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mccc2Q3ULD5 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mccc2Q3ULD5 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mccc2Q3ULD5 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mccc2Q3ULD5 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mccc2Q3ULD5 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mccc2Q3ULD5 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mccc2Q3ULD5 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mccc2Q3ULD5 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mccc2Q3ULD5 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mccc2Q3ULD5 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mccc2Q3ULD5 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mccc2Q3ULD5 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mccc2Q3ULD5 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mccc2Q3ULD5 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mccc2Q3ULD5 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mccc2Q3ULD5 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mccc2Q3ULD5 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mccc2Q3ULD5 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mccc2Q3ULD5 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mccc2Q3ULD5 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mccc2Q3ULD5 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mccc2Q3ULD5 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms