Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snx27Q3UHD6 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snx27Q3UHD6 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snx27Q3UHD6 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snx27Q3UHD6 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snx27Q3UHD6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snx27Q3UHD6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snx27Q3UHD6 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snx27Q3UHD6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snx27Q3UHD6 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snx27Q3UHD6 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Snx27Q3UHD6 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snx27Q3UHD6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snx27Q3UHD6 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Snx27Q3UHD6 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snx27Q3UHD6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snx27Q3UHD6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snx27Q3UHD6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snx27Q3UHD6 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snx27Q3UHD6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snx27Q3UHD6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snx27Q3UHD6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snx27Q3UHD6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snx27Q3UHD6 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snx27Q3UHD6 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snx27Q3UHD6 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snx27Q3UHD6 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snx27Q3UHD6 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snx27Q3UHD6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snx27Q3UHD6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snx27Q3UHD6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snx27Q3UHD6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snx27Q3UHD6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snx27Q3UHD6 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snx27Q3UHD6 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snx27Q3UHD6 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snx27Q3UHD6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snx27Q3UHD6 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Snx27Q3UHD6 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Snx27Q3UHD6 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Snx27Q3UHD6 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Snx27Q3UHD6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Snx27Q3UHD6 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Snx27Q3UHD6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Snx27Q3UHD6 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snx27Q3UHD6 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snx27Q3UHD6 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snx27Q3UHD6 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snx27Q3UHD6 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Snx27Q3UHD6 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snx27Q3UHD6 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snx27Q3UHD6 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snx27Q3UHD6 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snx27Q3UHD6 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snx27Q3UHD6 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Snx27Q3UHD6 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snx27Q3UHD6 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snx27Q3UHD6 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snx27Q3UHD6 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Snx27Q3UHD6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snx27Q3UHD6 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snx27Q3UHD6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snx27Q3UHD6 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snx27Q3UHD6 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snx27Q3UHD6 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Snx27Q3UHD6 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snx27Q3UHD6 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snx27Q3UHD6 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snx27Q3UHD6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snx27Q3UHD6 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Snx27Q3UHD6 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snx27Q3UHD6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snx27Q3UHD6 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snx27Q3UHD6 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snx27Q3UHD6 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snx27Q3UHD6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snx27Q3UHD6 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Snx27Q3UHD6 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snx27Q3UHD6 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snx27Q3UHD6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snx27Q3UHD6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snx27Q3UHD6 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snx27Q3UHD6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snx27Q3UHD6 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Snx27Q3UHD6 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Snx27Q3UHD6 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snx27Q3UHD6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snx27Q3UHD6 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Snx27Q3UHD6 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snx27Q3UHD6 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snx27Q3UHD6 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snx27Q3UHD6 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Snx27Q3UHD6 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snx27Q3UHD6 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snx27Q3UHD6 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snx27Q3UHD6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snx27Q3UHD6 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snx27Q3UHD6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snx27Q3UHD6 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Snx27Q3UHD6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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