Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGC7

Eif3j1, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit J-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3j1Q3UGC7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Eif3j1Q3UGC7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Eif3j1Q3UGC7 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Eif3j1Q3UGC7 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Eif3j1Q3UGC7 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Eif3j1Q3UGC7 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Eif3j1Q3UGC7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Eif3j1Q3UGC7 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Eif3j1Q3UGC7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Eif3j1Q3UGC7 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Eif3j1Q3UGC7 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Eif3j1Q3UGC7 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Eif3j1Q3UGC7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Eif3j1Q3UGC7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Eif3j1Q3UGC7 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Eif3j1Q3UGC7 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Eif3j1Q3UGC7 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Eif3j1Q3UGC7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Eif3j1Q3UGC7 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Eif3j1Q3UGC7 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Eif3j1Q3UGC7 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Eif3j1Q3UGC7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Eif3j1Q3UGC7 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Eif3j1Q3UGC7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Eif3j1Q3UGC7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Eif3j1Q3UGC7 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Eif3j1Q3UGC7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Eif3j1Q3UGC7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Eif3j1Q3UGC7 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Eif3j1Q3UGC7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Eif3j1Q3UGC7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Eif3j1Q3UGC7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Eif3j1Q3UGC7 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Eif3j1Q3UGC7 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Eif3j1Q3UGC7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Eif3j1Q3UGC7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Eif3j1Q3UGC7 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Eif3j1Q3UGC7 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Eif3j1Q3UGC7 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Eif3j1Q3UGC7 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Eif3j1Q3UGC7 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Eif3j1Q3UGC7 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Eif3j1Q3UGC7 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Eif3j1Q3UGC7 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Eif3j1Q3UGC7 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Eif3j1Q3UGC7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Eif3j1Q3UGC7 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Eif3j1Q3UGC7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Eif3j1Q3UGC7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Eif3j1Q3UGC7 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Eif3j1Q3UGC7 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Eif3j1Q3UGC7 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Eif3j1Q3UGC7 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Eif3j1Q3UGC7 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Eif3j1Q3UGC7 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Eif3j1Q3UGC7 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Eif3j1Q3UGC7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Eif3j1Q3UGC7 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Eif3j1Q3UGC7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Eif3j1Q3UGC7 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Eif3j1Q3UGC7 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Eif3j1Q3UGC7 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Eif3j1Q3UGC7 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Eif3j1Q3UGC7 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Eif3j1Q3UGC7 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Eif3j1Q3UGC7 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Eif3j1Q3UGC7 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Eif3j1Q3UGC7 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Eif3j1Q3UGC7 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Eif3j1Q3UGC7 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Eif3j1Q3UGC7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Eif3j1Q3UGC7 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Eif3j1Q3UGC7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Eif3j1Q3UGC7 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Eif3j1Q3UGC7 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Eif3j1Q3UGC7 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Eif3j1Q3UGC7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Eif3j1Q3UGC7 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Eif3j1Q3UGC7 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Eif3j1Q3UGC7 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Eif3j1Q3UGC7 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Eif3j1Q3UGC7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Eif3j1Q3UGC7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Eif3j1Q3UGC7 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Eif3j1Q3UGC7 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Eif3j1Q3UGC7 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Eif3j1Q3UGC7 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Eif3j1Q3UGC7 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Eif3j1Q3UGC7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Eif3j1Q3UGC7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Eif3j1Q3UGC7 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Eif3j1Q3UGC7 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Eif3j1Q3UGC7 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Eif3j1Q3UGC7 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Eif3j1Q3UGC7 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Eif3j1Q3UGC7 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Eif3j1Q3UGC7 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Eif3j1Q3UGC7 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Eif3j1Q3UGC7 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Eif3j1Q3UGC7 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 220.4 ms