Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFY0

Rrp36, Ribosomal RNA processing protein 36 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp36Q3UFY0 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rrp36Q3UFY0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rrp36Q3UFY0 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rrp36Q3UFY0 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rrp36Q3UFY0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Rrp36Q3UFY0 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rrp36Q3UFY0 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rrp36Q3UFY0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rrp36Q3UFY0 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rrp36Q3UFY0 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rrp36Q3UFY0 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rrp36Q3UFY0 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rrp36Q3UFY0 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rrp36Q3UFY0 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rrp36Q3UFY0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rrp36Q3UFY0 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rrp36Q3UFY0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rrp36Q3UFY0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rrp36Q3UFY0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rrp36Q3UFY0 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rrp36Q3UFY0 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rrp36Q3UFY0 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rrp36Q3UFY0 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rrp36Q3UFY0 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rrp36Q3UFY0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rrp36Q3UFY0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rrp36Q3UFY0 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rrp36Q3UFY0 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rrp36Q3UFY0 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rrp36Q3UFY0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rrp36Q3UFY0 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Rrp36Q3UFY0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Rrp36Q3UFY0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rrp36Q3UFY0 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rrp36Q3UFY0 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rrp36Q3UFY0 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rrp36Q3UFY0 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rrp36Q3UFY0 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rrp36Q3UFY0 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rrp36Q3UFY0 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rrp36Q3UFY0 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rrp36Q3UFY0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rrp36Q3UFY0 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rrp36Q3UFY0 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rrp36Q3UFY0 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rrp36Q3UFY0 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rrp36Q3UFY0 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rrp36Q3UFY0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rrp36Q3UFY0 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rrp36Q3UFY0 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rrp36Q3UFY0 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rrp36Q3UFY0 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rrp36Q3UFY0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rrp36Q3UFY0 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rrp36Q3UFY0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rrp36Q3UFY0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rrp36Q3UFY0 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rrp36Q3UFY0 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rrp36Q3UFY0 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rrp36Q3UFY0 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rrp36Q3UFY0 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rrp36Q3UFY0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rrp36Q3UFY0 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rrp36Q3UFY0 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rrp36Q3UFY0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rrp36Q3UFY0 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rrp36Q3UFY0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rrp36Q3UFY0 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rrp36Q3UFY0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rrp36Q3UFY0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rrp36Q3UFY0 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rrp36Q3UFY0 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rrp36Q3UFY0 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rrp36Q3UFY0 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rrp36Q3UFY0 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rrp36Q3UFY0 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rrp36Q3UFY0 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rrp36Q3UFY0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rrp36Q3UFY0 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rrp36Q3UFY0 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rrp36Q3UFY0 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rrp36Q3UFY0 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rrp36Q3UFY0 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rrp36Q3UFY0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rrp36Q3UFY0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rrp36Q3UFY0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rrp36Q3UFY0 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rrp36Q3UFY0 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rrp36Q3UFY0 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rrp36Q3UFY0 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Rrp36Q3UFY0 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rrp36Q3UFY0 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rrp36Q3UFY0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rrp36Q3UFY0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rrp36Q3UFY0 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rrp36Q3UFY0 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rrp36Q3UFY0 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rrp36Q3UFY0 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rrp36Q3UFY0 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rrp36Q3UFY0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms