Protein–RNA interactions for Protein: Q3UE70

Gm21748, Predicted gene, 21748, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21748Q3UE70 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21748Q3UE70 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21748Q3UE70 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21748Q3UE70 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21748Q3UE70 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21748Q3UE70 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21748Q3UE70 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21748Q3UE70 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21748Q3UE70 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21748Q3UE70 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21748Q3UE70 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21748Q3UE70 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21748Q3UE70 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21748Q3UE70 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21748Q3UE70 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21748Q3UE70 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21748Q3UE70 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21748Q3UE70 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21748Q3UE70 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21748Q3UE70 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Gm21748Q3UE70 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21748Q3UE70 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21748Q3UE70 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21748Q3UE70 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21748Q3UE70 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21748Q3UE70 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21748Q3UE70 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21748Q3UE70 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21748Q3UE70 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21748Q3UE70 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21748Q3UE70 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21748Q3UE70 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21748Q3UE70 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21748Q3UE70 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21748Q3UE70 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Gm21748Q3UE70 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21748Q3UE70 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21748Q3UE70 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Gm21748Q3UE70 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21748Q3UE70 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21748Q3UE70 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21748Q3UE70 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21748Q3UE70 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21748Q3UE70 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Gm21748Q3UE70 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21748Q3UE70 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Gm21748Q3UE70 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21748Q3UE70 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21748Q3UE70 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Gm21748Q3UE70 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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Gm21748Q3UE70 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21748Q3UE70 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21748Q3UE70 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21748Q3UE70 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21748Q3UE70 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21748Q3UE70 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21748Q3UE70 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21748Q3UE70 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21748Q3UE70 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21748Q3UE70 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21748Q3UE70 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21748Q3UE70 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21748Q3UE70 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21748Q3UE70 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21748Q3UE70 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21748Q3UE70 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21748Q3UE70 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21748Q3UE70 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21748Q3UE70 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21748Q3UE70 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21748Q3UE70 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21748Q3UE70 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21748Q3UE70 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21748Q3UE70 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21748Q3UE70 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21748Q3UE70 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21748Q3UE70 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21748Q3UE70 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21748Q3UE70 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm21748Q3UE70 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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