Protein–RNA interactions for Protein: Q3UD82

Parp8, Poly [ADP-ribose] polymerase 8, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp8Q3UD82 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Parp8Q3UD82 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Parp8Q3UD82 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Parp8Q3UD82 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Parp8Q3UD82 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Parp8Q3UD82 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Parp8Q3UD82 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Parp8Q3UD82 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Parp8Q3UD82 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Parp8Q3UD82 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Parp8Q3UD82 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Parp8Q3UD82 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Parp8Q3UD82 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Parp8Q3UD82 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Parp8Q3UD82 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Parp8Q3UD82 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Parp8Q3UD82 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Parp8Q3UD82 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Parp8Q3UD82 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Parp8Q3UD82 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Parp8Q3UD82 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Parp8Q3UD82 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Parp8Q3UD82 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Parp8Q3UD82 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Parp8Q3UD82 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Parp8Q3UD82 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Parp8Q3UD82 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Parp8Q3UD82 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Parp8Q3UD82 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Parp8Q3UD82 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Parp8Q3UD82 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Parp8Q3UD82 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Parp8Q3UD82 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Parp8Q3UD82 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Parp8Q3UD82 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Parp8Q3UD82 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Parp8Q3UD82 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Parp8Q3UD82 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Parp8Q3UD82 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Parp8Q3UD82 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Parp8Q3UD82 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Parp8Q3UD82 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Parp8Q3UD82 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Parp8Q3UD82 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Parp8Q3UD82 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Parp8Q3UD82 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Parp8Q3UD82 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Parp8Q3UD82 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Parp8Q3UD82 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Parp8Q3UD82 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Parp8Q3UD82 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Parp8Q3UD82 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Parp8Q3UD82 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Parp8Q3UD82 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Parp8Q3UD82 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Parp8Q3UD82 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Parp8Q3UD82 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Parp8Q3UD82 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Parp8Q3UD82 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Parp8Q3UD82 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Parp8Q3UD82 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Parp8Q3UD82 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Parp8Q3UD82 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Parp8Q3UD82 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Parp8Q3UD82 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Parp8Q3UD82 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Parp8Q3UD82 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Parp8Q3UD82 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Parp8Q3UD82 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Parp8Q3UD82 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Parp8Q3UD82 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Parp8Q3UD82 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Parp8Q3UD82 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Parp8Q3UD82 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Parp8Q3UD82 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Parp8Q3UD82 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Parp8Q3UD82 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Parp8Q3UD82 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Parp8Q3UD82 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Parp8Q3UD82 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Parp8Q3UD82 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Parp8Q3UD82 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Parp8Q3UD82 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Parp8Q3UD82 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Parp8Q3UD82 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Parp8Q3UD82 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Parp8Q3UD82 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Parp8Q3UD82 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Parp8Q3UD82 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Parp8Q3UD82 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Parp8Q3UD82 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Parp8Q3UD82 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Parp8Q3UD82 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Parp8Q3UD82 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Parp8Q3UD82 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Parp8Q3UD82 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Parp8Q3UD82 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Parp8Q3UD82 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Parp8Q3UD82 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Parp8Q3UD82 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms