Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rnf180Q3U827 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rnf180Q3U827 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rnf180Q3U827 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rnf180Q3U827 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rnf180Q3U827 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rnf180Q3U827 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rnf180Q3U827 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rnf180Q3U827 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Rnf180Q3U827 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Rnf180Q3U827 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rnf180Q3U827 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rnf180Q3U827 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rnf180Q3U827 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rnf180Q3U827 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rnf180Q3U827 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rnf180Q3U827 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rnf180Q3U827 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rnf180Q3U827 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rnf180Q3U827 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rnf180Q3U827 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rnf180Q3U827 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rnf180Q3U827 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rnf180Q3U827 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rnf180Q3U827 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rnf180Q3U827 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Rnf180Q3U827 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rnf180Q3U827 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rnf180Q3U827 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rnf180Q3U827 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rnf180Q3U827 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rnf180Q3U827 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rnf180Q3U827 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rnf180Q3U827 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rnf180Q3U827 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rnf180Q3U827 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rnf180Q3U827 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rnf180Q3U827 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rnf180Q3U827 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Rnf180Q3U827 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Rnf180Q3U827 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rnf180Q3U827 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rnf180Q3U827 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rnf180Q3U827 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rnf180Q3U827 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Rnf180Q3U827 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rnf180Q3U827 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Rnf180Q3U827 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rnf180Q3U827 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rnf180Q3U827 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rnf180Q3U827 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rnf180Q3U827 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rnf180Q3U827 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rnf180Q3U827 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rnf180Q3U827 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rnf180Q3U827 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rnf180Q3U827 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Rnf180Q3U827 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rnf180Q3U827 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rnf180Q3U827 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rnf180Q3U827 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rnf180Q3U827 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Rnf180Q3U827 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rnf180Q3U827 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rnf180Q3U827 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rnf180Q3U827 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rnf180Q3U827 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rnf180Q3U827 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rnf180Q3U827 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rnf180Q3U827 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rnf180Q3U827 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rnf180Q3U827 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rnf180Q3U827 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rnf180Q3U827 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rnf180Q3U827 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rnf180Q3U827 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rnf180Q3U827 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rnf180Q3U827 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rnf180Q3U827 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rnf180Q3U827 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rnf180Q3U827 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rnf180Q3U827 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rnf180Q3U827 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rnf180Q3U827 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rnf180Q3U827 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rnf180Q3U827 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rnf180Q3U827 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rnf180Q3U827 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rnf180Q3U827 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rnf180Q3U827 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rnf180Q3U827 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rnf180Q3U827 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rnf180Q3U827 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rnf180Q3U827 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rnf180Q3U827 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rnf180Q3U827 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Rnf180Q3U827 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Rnf180Q3U827 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rnf180Q3U827 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rnf180Q3U827 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms