Protein–RNA interactions for Protein: Q3U410

Klhl21, Kelch-like protein 21, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl21Q3U410 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klhl21Q3U410 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klhl21Q3U410 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klhl21Q3U410 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Klhl21Q3U410 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klhl21Q3U410 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klhl21Q3U410 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klhl21Q3U410 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klhl21Q3U410 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klhl21Q3U410 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klhl21Q3U410 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klhl21Q3U410 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klhl21Q3U410 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klhl21Q3U410 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klhl21Q3U410 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klhl21Q3U410 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klhl21Q3U410 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klhl21Q3U410 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klhl21Q3U410 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klhl21Q3U410 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klhl21Q3U410 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klhl21Q3U410 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klhl21Q3U410 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klhl21Q3U410 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klhl21Q3U410 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Klhl21Q3U410 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klhl21Q3U410 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klhl21Q3U410 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klhl21Q3U410 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klhl21Q3U410 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klhl21Q3U410 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klhl21Q3U410 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klhl21Q3U410 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klhl21Q3U410 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klhl21Q3U410 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klhl21Q3U410 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klhl21Q3U410 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klhl21Q3U410 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Klhl21Q3U410 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Klhl21Q3U410 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klhl21Q3U410 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klhl21Q3U410 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klhl21Q3U410 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klhl21Q3U410 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klhl21Q3U410 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klhl21Q3U410 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klhl21Q3U410 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Klhl21Q3U410 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klhl21Q3U410 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klhl21Q3U410 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klhl21Q3U410 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klhl21Q3U410 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klhl21Q3U410 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klhl21Q3U410 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klhl21Q3U410 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klhl21Q3U410 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klhl21Q3U410 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klhl21Q3U410 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klhl21Q3U410 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klhl21Q3U410 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klhl21Q3U410 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klhl21Q3U410 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klhl21Q3U410 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klhl21Q3U410 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Klhl21Q3U410 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klhl21Q3U410 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klhl21Q3U410 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klhl21Q3U410 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klhl21Q3U410 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klhl21Q3U410 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klhl21Q3U410 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klhl21Q3U410 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klhl21Q3U410 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klhl21Q3U410 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klhl21Q3U410 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klhl21Q3U410 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klhl21Q3U410 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klhl21Q3U410 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klhl21Q3U410 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klhl21Q3U410 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klhl21Q3U410 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klhl21Q3U410 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klhl21Q3U410 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klhl21Q3U410 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klhl21Q3U410 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klhl21Q3U410 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Klhl21Q3U410 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Klhl21Q3U410 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Klhl21Q3U410 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Klhl21Q3U410 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Klhl21Q3U410 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Klhl21Q3U410 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Klhl21Q3U410 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Klhl21Q3U410 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Klhl21Q3U410 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Klhl21Q3U410 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Klhl21Q3U410 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Klhl21Q3U410 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Klhl21Q3U410 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Klhl21Q3U410 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms