Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3E2

Fam117b, Protein FAM117B, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam117bQ3U3E2 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Fam117bQ3U3E2 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Fam117bQ3U3E2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fam117bQ3U3E2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fam117bQ3U3E2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fam117bQ3U3E2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Fam117bQ3U3E2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Fam117bQ3U3E2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Fam117bQ3U3E2 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fam117bQ3U3E2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fam117bQ3U3E2 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fam117bQ3U3E2 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fam117bQ3U3E2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fam117bQ3U3E2 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fam117bQ3U3E2 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fam117bQ3U3E2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fam117bQ3U3E2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fam117bQ3U3E2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fam117bQ3U3E2 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fam117bQ3U3E2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fam117bQ3U3E2 AC102523.2-201ENSMUST00000227813 983 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Fam117bQ3U3E2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fam117bQ3U3E2 Gemin6-201ENSMUST00000069486 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fam117bQ3U3E2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fam117bQ3U3E2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fam117bQ3U3E2 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fam117bQ3U3E2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fam117bQ3U3E2 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fam117bQ3U3E2 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Fam117bQ3U3E2 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Fam117bQ3U3E2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fam117bQ3U3E2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fam117bQ3U3E2 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fam117bQ3U3E2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fam117bQ3U3E2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Fam117bQ3U3E2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fam117bQ3U3E2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fam117bQ3U3E2 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fam117bQ3U3E2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fam117bQ3U3E2 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fam117bQ3U3E2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fam117bQ3U3E2 Gm14363-201ENSMUST00000122304 409 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Fam117bQ3U3E2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fam117bQ3U3E2 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fam117bQ3U3E2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fam117bQ3U3E2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fam117bQ3U3E2 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fam117bQ3U3E2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fam117bQ3U3E2 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fam117bQ3U3E2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fam117bQ3U3E2 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fam117bQ3U3E2 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fam117bQ3U3E2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fam117bQ3U3E2 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fam117bQ3U3E2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fam117bQ3U3E2 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fam117bQ3U3E2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fam117bQ3U3E2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fam117bQ3U3E2 AC154248.2-201ENSMUST00000221964 659 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fam117bQ3U3E2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fam117bQ3U3E2 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fam117bQ3U3E2 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fam117bQ3U3E2 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fam117bQ3U3E2 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fam117bQ3U3E2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam117bQ3U3E2 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam117bQ3U3E2 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam117bQ3U3E2 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam117bQ3U3E2 Gm12849-201ENSMUST00000120013 739 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam117bQ3U3E2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam117bQ3U3E2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam117bQ3U3E2 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam117bQ3U3E2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam117bQ3U3E2 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam117bQ3U3E2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam117bQ3U3E2 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam117bQ3U3E2 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam117bQ3U3E2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fam117bQ3U3E2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fam117bQ3U3E2 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fam117bQ3U3E2 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fam117bQ3U3E2 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fam117bQ3U3E2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fam117bQ3U3E2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fam117bQ3U3E2 Gm11569-201ENSMUST00000105057 869 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fam117bQ3U3E2 Gm38134-201ENSMUST00000191858 1234 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fam117bQ3U3E2 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fam117bQ3U3E2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fam117bQ3U3E2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fam117bQ3U3E2 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Fam117bQ3U3E2 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Fam117bQ3U3E2 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Fam117bQ3U3E2 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Fam117bQ3U3E2 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Fam117bQ3U3E2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Fam117bQ3U3E2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Fam117bQ3U3E2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Fam117bQ3U3E2 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Fam117bQ3U3E2 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Fam117bQ3U3E2 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms