Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1D9

UPF0602 protein C4orf47 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U1D9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q3U1D9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q3U1D9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q3U1D9 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q3U1D9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q3U1D9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q3U1D9 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q3U1D9 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q3U1D9 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q3U1D9 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q3U1D9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q3U1D9 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q3U1D9 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Q3U1D9 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Q3U1D9 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Q3U1D9 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q3U1D9 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q3U1D9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q3U1D9 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q3U1D9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Q3U1D9 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q3U1D9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q3U1D9 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q3U1D9 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q3U1D9 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q3U1D9 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q3U1D9 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q3U1D9 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q3U1D9 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q3U1D9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q3U1D9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q3U1D9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q3U1D9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q3U1D9 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q3U1D9 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q3U1D9 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q3U1D9 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q3U1D9 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q3U1D9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q3U1D9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q3U1D9 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q3U1D9 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q3U1D9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q3U1D9 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q3U1D9 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q3U1D9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q3U1D9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q3U1D9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q3U1D9 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q3U1D9 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q3U1D9 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q3U1D9 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q3U1D9 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q3U1D9 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q3U1D9 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q3U1D9 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q3U1D9 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q3U1D9 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q3U1D9 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Q3U1D9 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q3U1D9 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q3U1D9 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q3U1D9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q3U1D9 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q3U1D9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q3U1D9 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q3U1D9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q3U1D9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q3U1D9 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q3U1D9 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Q3U1D9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q3U1D9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q3U1D9 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q3U1D9 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q3U1D9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q3U1D9 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q3U1D9 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q3U1D9 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q3U1D9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q3U1D9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q3U1D9 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q3U1D9 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q3U1D9 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q3U1D9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q3U1D9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q3U1D9 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q3U1D9 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q3U1D9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q3U1D9 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q3U1D9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q3U1D9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q3U1D9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q3U1D9 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q3U1D9 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q3U1D9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q3U1D9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q3U1D9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q3U1D9 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q3U1D9 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q3U1D9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms