Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0P1

Palb2, Partner and localizer of BRCA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palb2Q3U0P1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Palb2Q3U0P1 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Palb2Q3U0P1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Palb2Q3U0P1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Palb2Q3U0P1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Palb2Q3U0P1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Palb2Q3U0P1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Palb2Q3U0P1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Palb2Q3U0P1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Palb2Q3U0P1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Palb2Q3U0P1 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Palb2Q3U0P1 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Palb2Q3U0P1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Palb2Q3U0P1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Palb2Q3U0P1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Palb2Q3U0P1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Palb2Q3U0P1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Palb2Q3U0P1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Palb2Q3U0P1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Palb2Q3U0P1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Palb2Q3U0P1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Palb2Q3U0P1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Palb2Q3U0P1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Palb2Q3U0P1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Palb2Q3U0P1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Palb2Q3U0P1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Palb2Q3U0P1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Palb2Q3U0P1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Palb2Q3U0P1 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Palb2Q3U0P1 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Palb2Q3U0P1 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Palb2Q3U0P1 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Palb2Q3U0P1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Palb2Q3U0P1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Palb2Q3U0P1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Palb2Q3U0P1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Palb2Q3U0P1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Palb2Q3U0P1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Palb2Q3U0P1 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Palb2Q3U0P1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Palb2Q3U0P1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Palb2Q3U0P1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Palb2Q3U0P1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Palb2Q3U0P1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Palb2Q3U0P1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Palb2Q3U0P1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Palb2Q3U0P1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Palb2Q3U0P1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Palb2Q3U0P1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Palb2Q3U0P1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Palb2Q3U0P1 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Palb2Q3U0P1 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Palb2Q3U0P1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Palb2Q3U0P1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Palb2Q3U0P1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Palb2Q3U0P1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Palb2Q3U0P1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Palb2Q3U0P1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Palb2Q3U0P1 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Palb2Q3U0P1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Palb2Q3U0P1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Palb2Q3U0P1 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Palb2Q3U0P1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Palb2Q3U0P1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Palb2Q3U0P1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Palb2Q3U0P1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Palb2Q3U0P1 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Palb2Q3U0P1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Palb2Q3U0P1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Palb2Q3U0P1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Palb2Q3U0P1 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Palb2Q3U0P1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Palb2Q3U0P1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Palb2Q3U0P1 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Palb2Q3U0P1 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Palb2Q3U0P1 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Palb2Q3U0P1 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Palb2Q3U0P1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Palb2Q3U0P1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Palb2Q3U0P1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Palb2Q3U0P1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Palb2Q3U0P1 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Palb2Q3U0P1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Palb2Q3U0P1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Palb2Q3U0P1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Palb2Q3U0P1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Palb2Q3U0P1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Palb2Q3U0P1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Palb2Q3U0P1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Palb2Q3U0P1 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Palb2Q3U0P1 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Palb2Q3U0P1 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Palb2Q3U0P1 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Palb2Q3U0P1 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Palb2Q3U0P1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Palb2Q3U0P1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Palb2Q3U0P1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Palb2Q3U0P1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Palb2Q3U0P1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Palb2Q3U0P1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms