Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0L2

Ankrd33b, Ankyrin repeat domain-containing protein 33B, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd33bQ3U0L2 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ankrd33bQ3U0L2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ankrd33bQ3U0L2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ankrd33bQ3U0L2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ankrd33bQ3U0L2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ankrd33bQ3U0L2 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ankrd33bQ3U0L2 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ankrd33bQ3U0L2 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ankrd33bQ3U0L2 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ankrd33bQ3U0L2 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ankrd33bQ3U0L2 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ankrd33bQ3U0L2 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ankrd33bQ3U0L2 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ankrd33bQ3U0L2 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ankrd33bQ3U0L2 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ankrd33bQ3U0L2 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ankrd33bQ3U0L2 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ankrd33bQ3U0L2 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ankrd33bQ3U0L2 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ankrd33bQ3U0L2 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ankrd33bQ3U0L2 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ankrd33bQ3U0L2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ankrd33bQ3U0L2 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ankrd33bQ3U0L2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ankrd33bQ3U0L2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ankrd33bQ3U0L2 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ankrd33bQ3U0L2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ankrd33bQ3U0L2 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ankrd33bQ3U0L2 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ankrd33bQ3U0L2 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ankrd33bQ3U0L2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ankrd33bQ3U0L2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ankrd33bQ3U0L2 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ankrd33bQ3U0L2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ankrd33bQ3U0L2 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ankrd33bQ3U0L2 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ankrd33bQ3U0L2 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ankrd33bQ3U0L2 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ankrd33bQ3U0L2 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms