Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0I6

Smim6, MCG148180, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim6Q3U0I6 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim6Q3U0I6 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim6Q3U0I6 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim6Q3U0I6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim6Q3U0I6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim6Q3U0I6 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim6Q3U0I6 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim6Q3U0I6 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim6Q3U0I6 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim6Q3U0I6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim6Q3U0I6 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim6Q3U0I6 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim6Q3U0I6 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim6Q3U0I6 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim6Q3U0I6 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim6Q3U0I6 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim6Q3U0I6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim6Q3U0I6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim6Q3U0I6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim6Q3U0I6 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim6Q3U0I6 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim6Q3U0I6 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim6Q3U0I6 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim6Q3U0I6 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim6Q3U0I6 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim6Q3U0I6 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim6Q3U0I6 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim6Q3U0I6 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim6Q3U0I6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim6Q3U0I6 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim6Q3U0I6 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim6Q3U0I6 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim6Q3U0I6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim6Q3U0I6 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim6Q3U0I6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim6Q3U0I6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim6Q3U0I6 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim6Q3U0I6 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim6Q3U0I6 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim6Q3U0I6 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim6Q3U0I6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim6Q3U0I6 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim6Q3U0I6 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim6Q3U0I6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim6Q3U0I6 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim6Q3U0I6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim6Q3U0I6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim6Q3U0I6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim6Q3U0I6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim6Q3U0I6 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim6Q3U0I6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim6Q3U0I6 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim6Q3U0I6 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim6Q3U0I6 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim6Q3U0I6 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim6Q3U0I6 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim6Q3U0I6 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim6Q3U0I6 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim6Q3U0I6 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim6Q3U0I6 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim6Q3U0I6 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim6Q3U0I6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim6Q3U0I6 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim6Q3U0I6 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim6Q3U0I6 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim6Q3U0I6 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim6Q3U0I6 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim6Q3U0I6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim6Q3U0I6 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim6Q3U0I6 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim6Q3U0I6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim6Q3U0I6 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim6Q3U0I6 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim6Q3U0I6 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim6Q3U0I6 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim6Q3U0I6 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim6Q3U0I6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim6Q3U0I6 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim6Q3U0I6 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim6Q3U0I6 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim6Q3U0I6 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim6Q3U0I6 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim6Q3U0I6 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim6Q3U0I6 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim6Q3U0I6 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim6Q3U0I6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim6Q3U0I6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim6Q3U0I6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim6Q3U0I6 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim6Q3U0I6 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim6Q3U0I6 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim6Q3U0I6 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim6Q3U0I6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim6Q3U0I6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim6Q3U0I6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim6Q3U0I6 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim6Q3U0I6 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim6Q3U0I6 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim6Q3U0I6 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim6Q3U0I6 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms