Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hace1Q3U0D9 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hace1Q3U0D9 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hace1Q3U0D9 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hace1Q3U0D9 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hace1Q3U0D9 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hace1Q3U0D9 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hace1Q3U0D9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hace1Q3U0D9 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hace1Q3U0D9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hace1Q3U0D9 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hace1Q3U0D9 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hace1Q3U0D9 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hace1Q3U0D9 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hace1Q3U0D9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hace1Q3U0D9 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hace1Q3U0D9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Hace1Q3U0D9 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hace1Q3U0D9 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hace1Q3U0D9 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hace1Q3U0D9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hace1Q3U0D9 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hace1Q3U0D9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hace1Q3U0D9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hace1Q3U0D9 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hace1Q3U0D9 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hace1Q3U0D9 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hace1Q3U0D9 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hace1Q3U0D9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hace1Q3U0D9 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hace1Q3U0D9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hace1Q3U0D9 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hace1Q3U0D9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hace1Q3U0D9 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hace1Q3U0D9 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Hace1Q3U0D9 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hace1Q3U0D9 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hace1Q3U0D9 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hace1Q3U0D9 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hace1Q3U0D9 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hace1Q3U0D9 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hace1Q3U0D9 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hace1Q3U0D9 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hace1Q3U0D9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hace1Q3U0D9 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hace1Q3U0D9 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hace1Q3U0D9 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hace1Q3U0D9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hace1Q3U0D9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hace1Q3U0D9 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hace1Q3U0D9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hace1Q3U0D9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hace1Q3U0D9 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hace1Q3U0D9 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hace1Q3U0D9 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hace1Q3U0D9 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hace1Q3U0D9 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hace1Q3U0D9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hace1Q3U0D9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hace1Q3U0D9 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hace1Q3U0D9 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hace1Q3U0D9 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hace1Q3U0D9 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hace1Q3U0D9 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hace1Q3U0D9 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hace1Q3U0D9 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hace1Q3U0D9 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Hace1Q3U0D9 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hace1Q3U0D9 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hace1Q3U0D9 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hace1Q3U0D9 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Hace1Q3U0D9 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hace1Q3U0D9 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Hace1Q3U0D9 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hace1Q3U0D9 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hace1Q3U0D9 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hace1Q3U0D9 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hace1Q3U0D9 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hace1Q3U0D9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hace1Q3U0D9 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hace1Q3U0D9 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hace1Q3U0D9 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hace1Q3U0D9 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hace1Q3U0D9 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hace1Q3U0D9 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Hace1Q3U0D9 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hace1Q3U0D9 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hace1Q3U0D9 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Hace1Q3U0D9 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hace1Q3U0D9 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Hace1Q3U0D9 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hace1Q3U0D9 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hace1Q3U0D9 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hace1Q3U0D9 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hace1Q3U0D9 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hace1Q3U0D9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hace1Q3U0D9 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hace1Q3U0D9 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hace1Q3U0D9 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hace1Q3U0D9 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms