Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNP5

V1rd19, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V1rd19Q3KNP5 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
V1rd19Q3KNP5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
V1rd19Q3KNP5 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
V1rd19Q3KNP5 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
V1rd19Q3KNP5 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
V1rd19Q3KNP5 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
V1rd19Q3KNP5 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
V1rd19Q3KNP5 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
V1rd19Q3KNP5 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
V1rd19Q3KNP5 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
V1rd19Q3KNP5 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
V1rd19Q3KNP5 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
V1rd19Q3KNP5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
V1rd19Q3KNP5 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
V1rd19Q3KNP5 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
V1rd19Q3KNP5 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
V1rd19Q3KNP5 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
V1rd19Q3KNP5 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
V1rd19Q3KNP5 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
V1rd19Q3KNP5 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
V1rd19Q3KNP5 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
V1rd19Q3KNP5 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
V1rd19Q3KNP5 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
V1rd19Q3KNP5 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
V1rd19Q3KNP5 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
V1rd19Q3KNP5 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
V1rd19Q3KNP5 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
V1rd19Q3KNP5 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
V1rd19Q3KNP5 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
V1rd19Q3KNP5 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
V1rd19Q3KNP5 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
V1rd19Q3KNP5 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
V1rd19Q3KNP5 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
V1rd19Q3KNP5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
V1rd19Q3KNP5 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
V1rd19Q3KNP5 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
V1rd19Q3KNP5 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
V1rd19Q3KNP5 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
V1rd19Q3KNP5 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
V1rd19Q3KNP5 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
V1rd19Q3KNP5 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
V1rd19Q3KNP5 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
V1rd19Q3KNP5 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
V1rd19Q3KNP5 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
V1rd19Q3KNP5 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
V1rd19Q3KNP5 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
V1rd19Q3KNP5 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
V1rd19Q3KNP5 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
V1rd19Q3KNP5 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
V1rd19Q3KNP5 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
V1rd19Q3KNP5 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
V1rd19Q3KNP5 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
V1rd19Q3KNP5 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
V1rd19Q3KNP5 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
V1rd19Q3KNP5 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
V1rd19Q3KNP5 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
V1rd19Q3KNP5 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
V1rd19Q3KNP5 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
V1rd19Q3KNP5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
V1rd19Q3KNP5 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
V1rd19Q3KNP5 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
V1rd19Q3KNP5 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
V1rd19Q3KNP5 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
V1rd19Q3KNP5 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
V1rd19Q3KNP5 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
V1rd19Q3KNP5 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
V1rd19Q3KNP5 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
V1rd19Q3KNP5 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
V1rd19Q3KNP5 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
V1rd19Q3KNP5 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
V1rd19Q3KNP5 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
V1rd19Q3KNP5 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
V1rd19Q3KNP5 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
V1rd19Q3KNP5 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
V1rd19Q3KNP5 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
V1rd19Q3KNP5 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
V1rd19Q3KNP5 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
V1rd19Q3KNP5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
V1rd19Q3KNP5 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
V1rd19Q3KNP5 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
V1rd19Q3KNP5 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
V1rd19Q3KNP5 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
V1rd19Q3KNP5 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
V1rd19Q3KNP5 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
V1rd19Q3KNP5 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
V1rd19Q3KNP5 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
V1rd19Q3KNP5 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
V1rd19Q3KNP5 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
V1rd19Q3KNP5 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
V1rd19Q3KNP5 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
V1rd19Q3KNP5 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
V1rd19Q3KNP5 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
V1rd19Q3KNP5 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
V1rd19Q3KNP5 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
V1rd19Q3KNP5 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
V1rd19Q3KNP5 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
V1rd19Q3KNP5 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
V1rd19Q3KNP5 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
V1rd19Q3KNP5 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
V1rd19Q3KNP5 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms