Protein–RNA interactions for Protein: Q2Q1W2

TRIM71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 868 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM71Q2Q1W2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM71Q2Q1W2 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM71Q2Q1W2 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM71Q2Q1W2 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM71Q2Q1W2 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM71Q2Q1W2 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM71Q2Q1W2 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM71Q2Q1W2 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM71Q2Q1W2 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM71Q2Q1W2 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM71Q2Q1W2 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM71Q2Q1W2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM71Q2Q1W2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM71Q2Q1W2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM71Q2Q1W2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM71Q2Q1W2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM71Q2Q1W2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM71Q2Q1W2 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM71Q2Q1W2 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM71Q2Q1W2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM71Q2Q1W2 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM71Q2Q1W2 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM71Q2Q1W2 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM71Q2Q1W2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM71Q2Q1W2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM71Q2Q1W2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM71Q2Q1W2 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM71Q2Q1W2 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM71Q2Q1W2 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM71Q2Q1W2 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM71Q2Q1W2 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM71Q2Q1W2 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM71Q2Q1W2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM71Q2Q1W2 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM71Q2Q1W2 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM71Q2Q1W2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM71Q2Q1W2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM71Q2Q1W2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM71Q2Q1W2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM71Q2Q1W2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM71Q2Q1W2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM71Q2Q1W2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM71Q2Q1W2 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM71Q2Q1W2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM71Q2Q1W2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM71Q2Q1W2 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM71Q2Q1W2 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM71Q2Q1W2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM71Q2Q1W2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM71Q2Q1W2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM71Q2Q1W2 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM71Q2Q1W2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM71Q2Q1W2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM71Q2Q1W2 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM71Q2Q1W2 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM71Q2Q1W2 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM71Q2Q1W2 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM71Q2Q1W2 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM71Q2Q1W2 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM71Q2Q1W2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM71Q2Q1W2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM71Q2Q1W2 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM71Q2Q1W2 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM71Q2Q1W2 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM71Q2Q1W2 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM71Q2Q1W2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM71Q2Q1W2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM71Q2Q1W2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM71Q2Q1W2 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM71Q2Q1W2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM71Q2Q1W2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM71Q2Q1W2 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM71Q2Q1W2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TRIM71Q2Q1W2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TRIM71Q2Q1W2 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM71Q2Q1W2 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM71Q2Q1W2 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM71Q2Q1W2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM71Q2Q1W2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM71Q2Q1W2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM71Q2Q1W2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM71Q2Q1W2 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM71Q2Q1W2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM71Q2Q1W2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM71Q2Q1W2 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM71Q2Q1W2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM71Q2Q1W2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM71Q2Q1W2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM71Q2Q1W2 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM71Q2Q1W2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM71Q2Q1W2 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM71Q2Q1W2 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM71Q2Q1W2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM71Q2Q1W2 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM71Q2Q1W2 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM71Q2Q1W2 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM71Q2Q1W2 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM71Q2Q1W2 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM71Q2Q1W2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM71Q2Q1W2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms