Protein–RNA interactions for Protein: Q1EG27

Myo3b, Myosin-IIIb, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo3bQ1EG27 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Myo3bQ1EG27 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Myo3bQ1EG27 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Myo3bQ1EG27 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Myo3bQ1EG27 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Myo3bQ1EG27 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Myo3bQ1EG27 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Myo3bQ1EG27 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Myo3bQ1EG27 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Myo3bQ1EG27 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Myo3bQ1EG27 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Myo3bQ1EG27 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Myo3bQ1EG27 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Myo3bQ1EG27 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Myo3bQ1EG27 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Myo3bQ1EG27 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Myo3bQ1EG27 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Myo3bQ1EG27 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Myo3bQ1EG27 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Myo3bQ1EG27 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Myo3bQ1EG27 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Myo3bQ1EG27 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Myo3bQ1EG27 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Myo3bQ1EG27 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Myo3bQ1EG27 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Myo3bQ1EG27 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Myo3bQ1EG27 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Myo3bQ1EG27 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Myo3bQ1EG27 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Myo3bQ1EG27 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Myo3bQ1EG27 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Myo3bQ1EG27 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Myo3bQ1EG27 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Myo3bQ1EG27 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Myo3bQ1EG27 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Myo3bQ1EG27 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Myo3bQ1EG27 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Myo3bQ1EG27 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Myo3bQ1EG27 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Myo3bQ1EG27 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Myo3bQ1EG27 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Myo3bQ1EG27 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Myo3bQ1EG27 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Myo3bQ1EG27 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Myo3bQ1EG27 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Myo3bQ1EG27 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Myo3bQ1EG27 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Myo3bQ1EG27 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Myo3bQ1EG27 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Myo3bQ1EG27 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Myo3bQ1EG27 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Myo3bQ1EG27 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Myo3bQ1EG27 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Myo3bQ1EG27 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Myo3bQ1EG27 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Myo3bQ1EG27 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Myo3bQ1EG27 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Myo3bQ1EG27 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Myo3bQ1EG27 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Myo3bQ1EG27 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Myo3bQ1EG27 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Myo3bQ1EG27 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Myo3bQ1EG27 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Myo3bQ1EG27 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Myo3bQ1EG27 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Myo3bQ1EG27 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Myo3bQ1EG27 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Myo3bQ1EG27 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Myo3bQ1EG27 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Myo3bQ1EG27 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Myo3bQ1EG27 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Myo3bQ1EG27 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Myo3bQ1EG27 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Myo3bQ1EG27 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Myo3bQ1EG27 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Myo3bQ1EG27 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Myo3bQ1EG27 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Myo3bQ1EG27 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Myo3bQ1EG27 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Myo3bQ1EG27 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Myo3bQ1EG27 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Myo3bQ1EG27 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Myo3bQ1EG27 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Myo3bQ1EG27 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Myo3bQ1EG27 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Myo3bQ1EG27 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Myo3bQ1EG27 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Myo3bQ1EG27 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Myo3bQ1EG27 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Myo3bQ1EG27 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Myo3bQ1EG27 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Myo3bQ1EG27 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Myo3bQ1EG27 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Myo3bQ1EG27 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Myo3bQ1EG27 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Myo3bQ1EG27 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Myo3bQ1EG27 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Myo3bQ1EG27 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Myo3bQ1EG27 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Myo3bQ1EG27 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms