Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FSCN1Q16658 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FSCN1Q16658 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FSCN1Q16658 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
FSCN1Q16658 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FSCN1Q16658 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FSCN1Q16658 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FSCN1Q16658 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FSCN1Q16658 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FSCN1Q16658 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FSCN1Q16658 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FSCN1Q16658 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FSCN1Q16658 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FSCN1Q16658 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FSCN1Q16658 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FSCN1Q16658 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
FSCN1Q16658 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FSCN1Q16658 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FSCN1Q16658 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FSCN1Q16658 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FSCN1Q16658 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FSCN1Q16658 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FSCN1Q16658 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FSCN1Q16658 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FSCN1Q16658 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FSCN1Q16658 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FSCN1Q16658 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FSCN1Q16658 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FSCN1Q16658 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FSCN1Q16658 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FSCN1Q16658 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FSCN1Q16658 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FSCN1Q16658 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FSCN1Q16658 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FSCN1Q16658 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FSCN1Q16658 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FSCN1Q16658 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FSCN1Q16658 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FSCN1Q16658 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FSCN1Q16658 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FSCN1Q16658 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FSCN1Q16658 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FSCN1Q16658 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FSCN1Q16658 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FSCN1Q16658 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FSCN1Q16658 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FSCN1Q16658 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FSCN1Q16658 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FSCN1Q16658 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FSCN1Q16658 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FSCN1Q16658 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FSCN1Q16658 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FSCN1Q16658 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FSCN1Q16658 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FSCN1Q16658 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FSCN1Q16658 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FSCN1Q16658 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
FSCN1Q16658 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FSCN1Q16658 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FSCN1Q16658 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FSCN1Q16658 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FSCN1Q16658 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FSCN1Q16658 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FSCN1Q16658 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FSCN1Q16658 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FSCN1Q16658 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FSCN1Q16658 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FSCN1Q16658 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FSCN1Q16658 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FSCN1Q16658 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FSCN1Q16658 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
FSCN1Q16658 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FSCN1Q16658 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FSCN1Q16658 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FSCN1Q16658 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FSCN1Q16658 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FSCN1Q16658 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FSCN1Q16658 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
FSCN1Q16658 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FSCN1Q16658 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FSCN1Q16658 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FSCN1Q16658 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FSCN1Q16658 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FSCN1Q16658 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FSCN1Q16658 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FSCN1Q16658 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FSCN1Q16658 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FSCN1Q16658 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FSCN1Q16658 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FSCN1Q16658 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FSCN1Q16658 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FSCN1Q16658 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FSCN1Q16658 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FSCN1Q16658 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FSCN1Q16658 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FSCN1Q16658 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
FSCN1Q16658 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
FSCN1Q16658 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FSCN1Q16658 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FSCN1Q16658 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.3 ms